screen技巧
使用NCBI自带的工具实现蛋白序列的批量下载
Orthofinder是做直系同源基因分析时常用软件,除此之外,还可以使用OrthoMCL,今天主要介绍Orthofinder软件的工作流程。 1. Orthofinder发表的工作流程如上图: 1.1 (a)将所有物种的...
从fasta基因组中提取反向互补序列,借助bedtools工具。 bedtools getfasta -fi Dlong_asm_chr.fasta -bed DlNIP.bed -s -fo DlNIP.bed.fa -fi 基因组文件 -bed 基因位置 共6列:【染色...
大部分植物的叶绿体基因组具有典型的四分体结构,即由LSC、SSC以及一对IR区域构成,IR和SSC区域的收缩与扩张是常见的进化事件。通过irscope工具可以将多个物种叶绿体的区域边界进行可视化对比...
SSR (Simple Sequence Repeat),即简单重复序列,是一种以PCR技术为核心的DNA分子标记技术,也称为微卫星序列或者串联重复。
基于WSL2的docker更改存储位置
interpro 查询结构域
HMMER ——hmmsearch 用法,参数
notepad++显示所有字符(隐藏的回车换行空格)转换CRLF
branch-site models 类似于branch model和site model的合集,主要假设基因的不同位点间(site)和系统发育树的不同分支间(branch)的ω值均是变化的,目的是检验前景枝中正选择作用对部分位点的...
在线绘制基因染色体位置图
下载ICGC数据库中的数据
blast+命令选择
科研人做汇报是少不了的,在汇报的时候为了强调ppt上的重点内容经常添加一些动作或者图形标记如箭头、圆圈等。今天小编给大家介绍一款能在汇报时可在屏幕上实时自由标记、突出重点内容的屏幕注...
miRNA的鉴定:利用miRDeep2软件进行已知及新(保守及非保守)的miRNA鉴定。miRDeep2会在reads比对到基因组上的位置两端分别延伸75、15bp进行结构预测。
MEGA作为一款进化树软件,用于分析来自物种和种群的DNA和蛋白质序列数据,可用于序列比对、进化树推断、估计分子进化速度、验证进化假说等。
论文怎么写出来的我不知道,但是发论文前查重都是必要的;查重犯难吗?来来来,小编给你捋一捋可靠查重网站! 查重网站推荐 1. Turnitin Turnitin是世界上主流的学术不端检测系统之一,Turni...
上一期给大家介绍了使用DNAman进行多重序列比对的方法,想了解的可以点击链接查看:多序列比对分析-Dnaman很好用!其实DNAman还有很多其他功能,今天我在和大家分享一下。 1. 绘制质粒图谱 绘...