小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具
文章投稿，除了文好当然还要“颜好”！在这个看脸的世界，为了给文章加分，各位老师学生也是做足功课了！但是不会编程敲代码？——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-06 09:07
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Daitoue
GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析
GEO2R是GEO在线分析工具，基于此工具可以对部分GEO样品数据进行基因差异表达分析。
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-21 17:19
- 阅读 ( 38557 )
GSEA分析需要的文件及格式
在作芯片数据或者是转录组数据的GSEA分析时候，需要四个文件： 1、基因表达数据文件； 2、表型数据文件； 3、功能基因集文件； 4、芯片注释文件； 这四个文件只需要分析者提供前两个文件即...
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- landy
- 发布于 2018-06-14 15:11
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landy
绘制基因结构图软件GSDS使用过程中图片的修改问题
在使用GSSE绘制基因结构或者是顺势作用元件时，如果图例太多，在网页展示不出来，这个时候你需要对图片进行修改.增大背景画布就可以显示了，点击下图红色箭头所指按钮，进入到图片编辑界面: 拉...
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- landy
- 发布于 2018-06-14 14:48
- 阅读 ( 11827 )
一个预测基因保守结构域网站
今天跟大家分享一个分析蛋白保守结构域的的网站： 网址：http://www.ebi.ac.uk/interpro/ 在上图的方框导入蛋白序列，点击submit，就开始运行，结果如下图所示： 这个网站不仅分析了蛋白的保...
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- landy
- 发布于 2018-06-08 18:06
- 阅读 ( 15233 )
如何快速获取多条序列长度信息
如何快速知道你的多个序列的长度呢？这里还是分享一个虚拟机的bio-linux的工具，samtools。命令行格式：samtools faidx xulie.fa(你的序列文件)结果会生成一个 xulie.fa.fai文件，也是就是在...
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- landy
- 发布于 2018-05-11 11:31
- 阅读 ( 3817 )
生信老顽童
ai助手帮我画环形堆叠柱状图
前两天看文章里面有一个很漂亮的环形堆叠柱状图,但是我懒得查资料,所以我尝试让ai帮我画一下 结果如下,这个是完整 的链接 https://www.cici.com/thread/w0ed44c9006bd080c 还是可以的...
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- xun
- 发布于 5天前
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xun
ai助手帮我构建新的qiime2分类器
在挖掘数据的时候发现有的数据用的是v2版本的,我手里只有全长的和v3-v4的,全长效果没那么好感觉,但是我好久没有看过qii2相关的东西了,有点忘了,刚好最近ai很火,我就尝试用ai帮我构建,过程如下...
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- xun
- 发布于 5天前
- 阅读 ( 64 )
安生水
AI写代码之批量设计引物
我们拿到一段序列之后想要设计引物通常会使用ncbi或者是primer3工具，而这些工具的在线版本都只能一个一个序列去设计，比较耗费时间，最好是使用本地版。在这里我让AI告诉我怎么做，只要阐述清...
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- Ti Amo
- 发布于 2025-03-17 17:40
- 阅读 ( 185 )
Ti Amo
BaiduPCS-Go 报错 | 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit superfile2 failed
在使用BaiduPCS-Go上传文件时报错： [1] ↑ 1.03GB/1.03GB 1.81MB/s in 39s ............[1] 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit...
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- rzx
- 发布于 2024-12-19 17:17
- 阅读 ( 438 )
rzx
samtools | 提取部分染色体的bam信息
01. samtools提取bam文件中某部分染色体相关信息 samtools view -b -h XX.bam chr1 chr4 >XX2.bam 02. samtools构建bam文件的索引 samtools index XX2.bam
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- rzx
- 发布于 2024-12-19 16:28
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Trinity报错“Error, not recognizing read name formatting”
在使用trinity做de novo的时候，发现软件报错了
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-12-18 14:38
- 阅读 ( 479 )
每天学习一点点
hisat2-build报错：Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)
hisat2-build报错：Error: Encountered internal HISAT2 exception (#1)
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- 安生水
- 发布于 2024-12-11 15:15
- 阅读 ( 626 )
linux 编码转换
在linux里面编辑二进制文件有以下两种方法： 1. vim 打开二进制文件： vim -b 文件 将内容转换成16进制： :%!xxd 转换回来： :%!xxd -r 2. iconv # 将UTF-8编码的wx.txt文件转换为GB...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-12-03 14:56
- 阅读 ( 504 )
annovar的染色体识别问题
如果是非数字形式的染色体编号（尤其是其中有特殊字符），annovar的注释可能会有问题，需要改成数字格式
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-11-22 10:02
- 阅读 ( 494 )
seqkit | 对fa序列文件中序列长度进行筛选
seqkit seq -m 50 XX.fa > XX1.fa 将XX.fa文件中序列长度低于50的序列删除
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- rzx
- 发布于 2024-11-19 19:01
- 阅读 ( 629 )
