MySQL报错:ERROR 2002 (HY000)
interpro 查询结构域
uniref50 数据库下载及格式化
比如在singularity中运行: singularity exec /share/singularity_images/reseq_v1.2.sif fastqc $datadir/*.gz -o $workdir/1.fastqc 可能报错: 可以加一个-t选项,多线程运行,如下图,...
Pheatmap绘制多分组热图
seqkit是一个序列处理神器,有统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等功能。 seqkit 一共有37个可用的命令,详细内容如下
组学大讲堂云共享服务器上线!
duplicate_gene_classifier属于MCScanX的核心程序,用于基因分类,统计全基因组不同类型复制事件的数目。 命令行格式: $duplicate_gene_classifier Dl Dl是物种缩写,是Dl.blast文件。在运...
hmmer之hmmbuild用法
GetOrganelle软件是一款由郁文斌老师开发的一套全新的细胞器基因组组装工具,可以对大规模的细胞器基因组进行快速、准确及自动化组装。
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HMMER ——hmmsearch 用法,参数
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HMMER 隐马尔可夫模型序列最新下载方法
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绘制进化树,是科研人的基础技能之一,而一张好看的进化树图,不仅能直观得展现基因或物种间的发育进化关系,更能增加文章的观赏性,赢得审稿人的青睐。今天给大家介绍的是一款非常实用且操作简...
branch-site models 类似于branch model和site model的合集,主要假设基因的不同位点间(site)和系统发育树的不同分支间(branch)的ω值均是变化的,目的是检验前景枝中正选择作用对部分位点的...
codeml是PAML软件包下的一个程序,在估算蛋白编码序列同义替换和非同义替换速率以及检测序列是否经受正选择分析中受到广泛应用。 对于一棵系统发育进化树,在考虑其不同序列间(site)和不同支...
braker