8月相约南京--群体遗传进化GWAS分析、T2T基因组、泛基因家族、宏基因组等主题培训！
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- 生信老顽童
- 发布于 2024-06-15 09:24
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生信老顽童
在运行R时报错缺失libpcre2-8.so.0这个共享库文件
libpcre2-8.so.0是PCRE（Perl Compatible Regular Expressions）库的一个版本，通常用于支持正则表达式。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-04-30 16:14
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每天学习一点点
给进化树标定化石时间
进化树（Phylogenetic Tree）是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中，每个分支点（节点）代表一个共同祖先，而每个末端的分支（叶节点）代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间，即在进化树上标注时间点，为进化树提供了一个时间框架，便于超度量树的构建
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- Ti Amo
- 发布于 2024-07-10 17:43
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Ti Amo
核苷酸多样性π的计算
核苷酸多样性（nucleotide diversity），记为π，是分子遗传学中一个重要的概念，可以作为一个群体遗传的重要指标去衡量种群的遗传多样度水平，也可以用在单个基因的多序列比对之中找到受选择的...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-11-12 18:14
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TWAS分析的原理和工具
TWAS（Transcriptome-wide Association Study）是一种用于研究基因表达和疾病之间关系的方法，通过对全基因组的基因表达数据进行统计分析，以识别与特定疾病或性状相关的基因表达变异。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-11-12 17:29
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omicsgene
An introduction to PERMANOVA and ANOSIM
PERMANOVA（Permutational Multivariate Analysis of Variance）和 ANOSIM（Analysis of Similarities）都是用于分析和比较群组间多元数据差异的统计方法。它们特别适用于生态和环境科学领域，...
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- xun
- 发布于 2024-06-05 14:33
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xun
安生水
IF=8.7 | T2T康乃馨基因组揭示了相同基因在不同单倍型基因组中的表达差异
2024年1月 Horticulture Research杂志在线发表了一篇题为“The haplotype-resolved telomere-to-telomere carnation (Dianthus caryophyllus) genome reveals the correlation between genome ar...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-04-15 13:34
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使用peer根据表达量数据推断隐藏因子
在做eQTL分析时需要提供隐藏因子作为分析的部分协变量，分析中隐藏因子的引入主要是用来排除影响表达量数据的一些混淆因素，例如样本的采样环境、样本批次、其他位置因素等，这些因素视作分析中的无关因素(即一些无法测量的，但是会影响基因表达的因素)，需要进行预先处理。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-06-19 15:39
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qsub任务投递系统的常用命令 SGE任务调度
qsub全称为”Queue Submitter”，是Sun Grid Engine (SGE)集群管理软件中的一个命令行工具。它的主要作用是将用户提交的任务加入到队列中，等待计算节点执行。qsub可在Unix/Linux等操作系统下使用...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-06-26 17:54
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sort: write failed: /tmp/sort0JADkd: No space left on device报错
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- 安生水
- 发布于 2024-04-12 10:29
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