omicsgene
常见的预后预测的模型介绍
预后预测模型在医学和生物信息学领域中发挥着重要作用，用于预测疾病进展、治疗反应和生存率等重要临床结果。根据数据类型、研究目标和所需的解释性，可以选择不同的统计和机器学习模型。以下是...
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- xun
- 发布于 2024-02-21 14:06
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xun
2024最新版《基因家族分析实操》直播培训开始报名了！
快来参加组学大讲堂直播课程，两天时间实现SCI自由！ 我们使用关键词“genome wide gene family”粗略统计了近3年基因家族分析类SCI数量：2021年1912篇，2022年2111篇，2023年1890篇。 考虑到...
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- 生信老顽童
- 发布于 2024-02-01 11:46
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生信老顽童
给进化树标定化石时间
进化树（Phylogenetic Tree）是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中，每个分支点（节点）代表一个共同祖先，而每个末端的分支（叶节点）代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间，即在进化树上标注时间点，为进化树提供了一个时间框架，便于超度量树的构建
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- Ti Amo
- 发布于 2024-07-10 17:43
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Ti Amo
不同物种基因组之间的比对与可视化
基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较，以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-03-13 15:14
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安生水
对水稻做GO和KEGG富集分析，如何获取水稻的数据库？
我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候，需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-07-05 14:39
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每天学习一点点
一些常见R代码的报错和解决办法
Error: cannot allocate vector of size X Gb 这种问题尤其在32位R版本中常见，因为它们对可用内存有限制。即使在64位版本中，当数据集非常大时也可能遇到内存问题。解决这个问题通常需要优化...
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- xun
- 发布于 2024-03-25 14:39
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IF=8.7 | T2T康乃馨基因组揭示了相同基因在不同单倍型基因组中的表达差异
2024年1月 Horticulture Research杂志在线发表了一篇题为“The haplotype-resolved telomere-to-telomere carnation (Dianthus caryophyllus) genome reveals the correlation between genome ar...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-04-15 13:34
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R语言ggplot2散点图添加拟合曲线和回归方程
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- 星莓
- 发布于 2024-02-23 17:10
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星莓
vscode更新导致低版本系统无法登陆的问题
fa最新版vscode登录时会报错,因为一些系统基础软件版本太低了,所以如果不想回退版本,就需要更新一下 ▶ ldd --version #来看一眼自己的glibc版本 ldd (GNU libc) 2.37 Copyright (C) 2023...
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- xun
- 发布于 2024-02-02 14:24
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sort -V | 对字符和数值组合的排序
sort命令有很多选项参数，其中-n选项可以对文件内容进行数字排序。但是当想排序的列是由字符和数字组成的时候，这个选项就不能达到想要的效果。 1.例如，对某个文件列进行排序： #cat 1.txt11...
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- rzx
- 发布于 2024-01-05 13:28
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rzx
R语言使用ggraph绘图导出pdf报错——“invalid font type”
使用ggraph绘图，在结果导出pdf的时候报错，不可用的字体类型“invalid font type” 如果继续使用ggsave导出，可以直接载入字体： library(showtext) font_add('Times','/Library/Fonts/T...
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-01-11 14:14
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一行代码检查GWAS分析中表型数据的错误
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- 星莓
- 发布于 2023-12-13 10:56
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GATK|Timeout of 30000 milliseconds was reached while trying to acquire a lock on file raw.vcf.tmp.idx.
解决办法：https://www.omicsclass.com/article/2194 这里还有一个需要做的步骤，就是先将raw.vcf.tmp.idx文件找到并删除，一般情况下这个文件是空的。 然后再在命令行中添加-disable_auto_in...
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- rzx
- 发布于 2023-12-15 10:23
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R| set.seed()作用使随机结果具有复现性
例如在R语言中，rnorm()函数为随机生成多个随机数，每次使用都会得到不同的结果 > rnorm(3) [1] -2.0235077 0.3552526 0.6239982 > rnorm(3) [1] 1.101044 -1.297740 1.717356 如...
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- rzx
- 发布于 2024-02-19 14:26
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