awk正则表达式使用外部变量

awk正则表达式使用外部变量

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-02-04 11:35
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遗传图构建-SNP标记分型

遗传图构建-SNP标记分型

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-04-17 09:07
  • 阅读 ( 988 )

CLUMPAK安装

CLUMPAK这个软件很古老,安装起来也很麻烦,记录一下https://tau.evolseq.net/clumpak/download/CLUMPAK.zip 安装包下载路径解压以后添加库的位置到环境 export PERL5LIB=path/CLUMPAK:$PERL5LI...

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  • xun
  • 发布于 2024-01-26 17:02
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甲基化水平如何计算

甲基化水平如何计算

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  • 安生水
  • 发布于 2024-07-11 09:51
  • 阅读 ( 968 )

ftp链接登陆下载文件

我们进行文件下载的时候通常可以直接通过网页的download或者是服务器的wget命令,但是是一个需要登陆的ftp地址,这两个方法就不太适用了,本文提供给大家一些ftp地址的登陆方法。 1. 个人电...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-08 10:41
  • 阅读 ( 958 )

超快的文件传输软件trzsz

对于服务器而言,和本地的文件互相传输是家常便饭,scp虽然快速,但是毕竟要打很多字,有点麻烦,lrzsz十多年没跟新了,所以我推荐了这个软件trzsz用法和lrzsz差不多,也有额外的功能,有需要自己看帮助...

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  • xun
  • 发布于 2024-01-09 10:56
  • 阅读 ( 946 )

sort: write failed: /tmp/sort0JADkd: No space left on device报错

sort: write failed: /tmp/sort0JADkd: No space left on device报错

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  • 安生水
  • 发布于 2024-04-12 10:29
  • 阅读 ( 945 )

htop查看程序的io占用

传统的top大家都用的很多,但是top里不会显示磁盘io,而在我们服务器里,磁盘高io往往才是程序运行的瓶颈 新版 的htop新增了io 的查看,读写过高对应选项会变成红色,方便我们查看,除此之外htop还有...

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  • xun
  • 发布于 2024-04-25 11:03
  • 阅读 ( 939 )

下载AI字体

最近在使用AI软件对iTol生成的pdf文件进行修改。当AI导入文件后弹出提示窗口如下: “缺少字体。将使用替换字体显示受影响的文本。” 一般情况下可以忽略提示。 但这次的文件在忽略提示直接导...

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  • rzx
  • 发布于 2023-12-18 15:40
  • 阅读 ( 937 )

LD衰减距离

LD衰减距离

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  • 安生水
  • 发布于 2024-06-27 09:50
  • 阅读 ( 936 )

make Cladogram with microbiomemarker

给大家介绍一个R包用于绘制Cladogram,直接附上代码: if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) { install.packages("BiocManager")}​BiocManager::install("microbiomeMark...

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  • xun
  • 发布于 2023-12-28 11:11
  • 阅读 ( 936 )

seqcluster软件安装

seqcluster软件安装

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  • 安生水
  • 发布于 2024-01-10 13:38
  • 阅读 ( 924 )

topGO报错

在r包topgo里面绘制node图的函数是showSigOfNodes(),其中提供的第二个参数不能有0,否则会报错: showSigOfNodes()拆分之后是: sampleGOdata和score(resultKS.elim)是提供给函数的       ...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-22 11:51
  • 阅读 ( 899 )

记录一个数据下载:GSE12417

geo_gene_exp_download.r

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-12-04 10:14
  • 阅读 ( 898 )

qsub任务投递系统的常用命令 SGE任务调度

qsub全称为”Queue Submitter”,是Sun Grid Engine (SGE)集群管理软件中的一个命令行工具。它的主要作用是将用户提交的任务加入到队列中,等待计算节点执行。qsub可在Unix/Linux等操作系统下使用...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-06-26 17:54
  • 阅读 ( 887 )

GFF或GTF格式转bed

GFF或GTF格式转bed

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  • 安生水
  • 发布于 2024-03-14 14:02
  • 阅读 ( 886 )

绘制venn图报错Unexpected parameter length for "category"

在进行韦恩图绘制的时候出现报错: 出现这个报错的原因是在输入数据应当是一个有名字的list,要求是这个list中的每个元素都有名字。 venn <- list(A,B,C)names(venn) <- c("A","B",...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-03-01 17:25
  • 阅读 ( 886 )

借助perl脚本进行文件整理 | 将按第一列信息整理的文件改成按照第二列信息整理

perl data.pl id1.txt id2.txt 现有一文件,有两列,是按照第一列内容进行展示的,如下图:A    green;red;blueB    yellow;greenC    red;blue;grey;pink;blankD    green;grey现在想将文件...

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  • rzx
  • 发布于 2023-12-28 15:32
  • 阅读 ( 883 )

桑基图绘制

桑基图是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名,此后便以其名字命名为“桑基图”。...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-23 17:49
  • 阅读 ( 876 )

使用compare_means()t.test进行显著性检验时报错

compare_means()函数进行t.test时报错——“not enough 'x' observation”