食管癌 10X多样本(GSE145370)
介绍如何修改已经load的镜像的镜像名/版本号
circos改变某两条染色体之间的距离
使用gtfToGenePred的命令和报错: gtfToGenePred -genePredExt Drosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf refFlat.tmp.txtDrosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf (GFF not supported by t...
idealTree:lib: sill idealTree buildDeps 安装JupyterHub 卡住
如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组,然后使用filter函数结合any函数来判断每个分组是否满足特定条件并进行过滤。
Mac | Mac M 芯片应用意外退出问题
甲基化水平计算
这个错误通常发生在尝试使用R的install.packages函数安装新的包时。错误信息"fail to lock directory"意味着R不能锁定用于安装包的目录,这通常是因为之前的安装进程没有正确完成,导致锁文件(一个隐藏的文件,用于防止同时写入目录)仍然存在。
R语言绘制差异表达火山图
有的文章会在模块化的群落里加上Convex Hull ,类似这样,如何实现呢,可以借助ggforce的geom_mark_hul 比如我们的示例代码稍作修改 library(ggforce) 主要是加了最后一行,的geom_mark_hull...
单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)
R markdwon 代码块选项说明:
10X Visium空间转录组图像
通常会从同源、转录组、从头三个方面进行基因结构注释,其中PASA是转录组注释的常用软件。 报错: 把三代转录组数据投入PASA是出现报错:unique constraint failed: asmbl_link.asmbl_acc, as...
基因组调研图有助于了解即将组装的这个物种的基因组复杂程度,为后续的正式的基因组组装去提供一些依据。基因组的复杂程度可以从基因组大小,倍性,杂合度,重复率等方面去进行评价。 用什么来...
gdal 报错
在Linux系统中,sed(stream editor)命令是一个非常强大的文本处理工具。它主要用于对文本文件进行过滤和转换操作,支持非交互式的文本编辑。今天,我们就来深入了解一下sed命令的详细使用方法...
“ 2023年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Meta-analysis identifying gut microbial biomarkers of Qinghai-Tibet Plateau populations and the functionality of microbiota-derived b...
读 10X的空间转录组数据报错