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DockerHub镜像无法下载的解决方案

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omicsgene
发布于 2024-08-30 16:31
阅读 ( 748 )

库文件位置问题

7 The following object is masked from ‘package:VennDiagram’: 8 9 ellipse 10 11 Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 12 unable to l...

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xun
发布于 2023-11-30 17:00
阅读 ( 738 )

GEO单细胞转录组数据挖掘示例代码汇总

单细胞数据挖掘示例代码

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omicsgene
发布于 2024-06-11 17:18
阅读 ( 737 )

好用的perl模块推荐

Path::Tiny 是一个专注于简洁性和便利性的 Perl 模块，用于处理文件和目录操作。以下是 Path::Tiny 的一些主要功能 1，目录相关在perl 里很多人会使用 mkdir path unless(-d path); 来创建...

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xun
发布于 2023-12-07 16:16
阅读 ( 729 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(GSE161529)

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omicsgene
发布于 2024-06-27 13:48
阅读 ( 725 )

使用peer根据表达量数据推断隐藏因子

在做eQTL分析时需要提供隐藏因子作为分析的部分协变量，分析中隐藏因子的引入主要是用来排除影响表达量数据的一些混淆因素，例如样本的采样环境、样本批次、其他位置因素等，这些因素视作分析中的无关因素(即一些无法测量的，但是会影响基因表达的因素)，需要进行预先处理。

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每天学习一点点
发布于 2024-06-19 15:39
阅读 ( 711 )

Python模块导入的路径索引

在使用python的时候经常需要调用库及module，有的时候分明已经import了，在运行的时候却收到 ModuleNotFoundError的报错。那么Python到底是从哪里、以什么样的顺序调用的呢？在Python中有内建...

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Ti Amo
发布于 2023-12-05 10:17
阅读 ( 699 )

qiime自带的alpha_diversity.py脚本报错

alpha_diversity.py -i some.biom -m observed_species,shannon,chao1,simpson,ace,goods_coverage 在运行时报错 File "/share/work/biosoft/python/Python-v2.7.11/lib/python2.7/site-p...

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xun
发布于 2024-03-11 09:43
阅读 ( 691 )

bowtie2 将fasta序列比对到参考基因组

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安生水
发布于 2024-08-16 10:26
阅读 ( 689 )

MarkDuplicates (GATK)报错：打开的文件句柄过多(Too many open files)

使用GATK对bam文件进行去重操作的时候发现报错了

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每天学习一点点
发布于 2024-02-21 14:29
阅读 ( 683 )

单细胞转录组-infer CNV拷贝数变异分析介绍

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omicsgene
发布于 2024-08-26 17:20
阅读 ( 680 )

RunUMAP函数报错,

执行降维分析的函数,umpa的时候报错 brain <- RunUMAP(brain, reduction = "pca", dims = 1:30) 报错信息如下: Error in irlba::irlba(L, nv = n, nu = 0, maxit = iters) : function '...

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xun
发布于 2024-07-25 14:15
阅读 ( 652 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-非小細胞肺癌（NSCLC）(GSE127465)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-癌（NSCLC）(GSE127465)

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omicsgene
发布于 2024-07-24 11:11
阅读 ( 647 )

基于 gff 文件构建 TxDb 包

TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的，用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb （transcript database）包，有两种构建方式，一...

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安生水
发布于 2024-05-15 16:41
阅读 ( 643 )

TukeyHSD报错

Error in TukeyHSD.aov(., ...) : no factors in the fitted model Calls: %>% ... is.data.frame -> <Anonymous> -> TukeyHSD -> TukeyHSD.aov In addition: Warning mess...

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xun
发布于 2024-03-08 10:16
阅读 ( 643 )

svg2xxx运行报错

/share/work/biosoft/tools/distributing_svg_4.74/svg2xxx_release/svg2xxx all.KEGG.svg ./ -dpi 300 Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedOperationException: The Security Ma...