“ 2024年9月 BMC (BioMed Central)发表了一篇题为“Trait-based study predicts glycerol/diol dehydratases as a key function of the gut microbiota of hindgut-fermenting carnivores(Saccha...
如果文件夹名称中有空格,如果不进行特殊处理scp指令无法对文件夹名称进行正确识别,就会出现“No such file or directory”的报错信息
蛋白质组是一个细胞、组织或生物体中所表达的全部蛋白质,在基础研究、疾病治疗、分子医学、生物进化等多方面的研究中发挥着重要作用。不同样本中的蛋白质种类复杂,想要筛选出核心蛋白质,需要...
在linux里面编辑二进制文件有以下两种方法: 1. vim 打开二进制文件: vim -b 文件 将内容转换成16进制: :%!xxd 转换回来: :%!xxd -r 2. iconv # 将UTF-8编码的wx.txt文件转换为GB...
如果是非数字形式的染色体编号(尤其是其中有特殊字符),annovar的注释可能会有问题,需要改成数字格式
在使用trinity做de novo的时候,发现软件报错了
非模式物种10X空间转录组单细胞参考基因组构建
https://openssl-library.org/source/old/3.0/index.html
通常来说,进行图片绘制的时候如果存在数据分布差异过大的情况,我们更倾向于选择坐标系截断(gg.map等)的方式去展示于结论更加相关的信息。但是截断毕竟会损失部分信息,如果想要更加全面...
inferCNV 测试
报错: 用R进行相关性分析的时候出现报错: Error in cor(x, y, use = use, method = method) : incompatible dimensionsCalls: corr.test -> cor 到脚本里看发现报错出现在这个函数里:...
Metadata CRC error detected at xfs _ bmbt _ read _ verify+0x12/0xb0 [xfs], xfs _ bmbt block 0xc9132f8 [ 4.863216] XFS(dm-0): Unmount and run xfs _ repair
在使用BaiduPCS-Go上传文件时报错: [1] ↑ 1.03GB/1.03GB 1.81MB/s in 39s ............[1] 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit...
ImportError: pycurl: libcurl link-time ssl backend (nss) is different from compile-time ssl backend (none/other)
拟南芥单细胞分析流程
组学大讲堂云服务器conda环境配置:
“ 2024年11月《Genomics》杂志发表了一篇题为“ Genomic evolution and patterns of horizontal gene transfer in Papilio”的比较基因组文章。文章研究了11个凤蝶物种间的进化关系,分析物种...
clusterprofile 支持的物种GO和KEGG富集分析orgdb
不同物种进行转录组分析的时候流程大致相同,但是当我们做的物种有一个庞大的基因组,那么流程中有一些参数需要进行修改: 1. Markdup和SplitNTrim的时候不要生成bai的索引,主要是 Markdup的...
我们进行kegg富集分析之后,除了会得到差异基因和KO编号对应的KOlist信息,还会拿到kegg pathway map的信息,分为html和png的结果展示,大概是这样的结果: 一般来说我们最好检查一下,这里...