惊喜价！转录组299元/个
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- 生信老顽童
- 发布于 2024-05-08 09:07
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生信老顽童
SCTransform ,Error: useNames = NA is defunct
SCTransform在seuratv4的时候没问题,升级到v5的时候不工作,出现报错 > brain <- SCTransform(rep, assay = "Spatial", verbose = TRUE)Running SCTransform on assay: SpatialRunning SC...
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- xun
- 发布于 2024-07-25 15:37
- 阅读 ( 520 )
xun
单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)
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- omicsgene
- 发布于 2024-07-25 11:01
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omicsgene
单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)
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- omicsgene
- 发布于 2024-07-22 18:21
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group_by()和any()连用判断每个分组中的元素是否满足特定条件
如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组，然后使用filter函数结合any函数来判断每个分组是否满足特定条件并进行过滤。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-08-07 10:46
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每天学习一点点
IF=4.9 | 多倍体割手密IAA基因家族分析鉴定
“ 2024年7月国际分子科学杂志(International Journal of Molecular Sciences)发表了一篇题为“ Genome-Wide Analysis of the Auxin/Indoleacetic Acid(Aux/IAA) Gene Family in Autopolyploid...
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- rzx
- 发布于 2024-08-29 15:55
- 阅读 ( 485 )
rzx
libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错
libgomp.so.1: version `GOMP_4.5' not found 报错
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- 安生水
- 发布于 2024-08-22 15:05
- 阅读 ( 472 )
安生水
用seqtk随机提取指定数目的序列
如果数据测多了，我们可以使用seqtk对fastq文件进行随机抽样来减小分析的数据量。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-08-27 17:43
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组装"预实验" | 基因组调研图
基因组调研图有助于了解即将组装的这个物种的基因组复杂程度，为后续的正式的基因组组装去提供一些依据。基因组的复杂程度可以从基因组大小，倍性，杂合度，重复率等方面去进行评价。 用什么来...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-07-30 15:39
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Ti Amo
NCBI下载的单细胞数据只有read1和read2如何读入cellranger
NCBI下载的单细胞数据只有read1和read2如何读入cellranger
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- omicsgene
- 发布于 2024-08-22 10:03
- 阅读 ( 416 )
eQTpLot包的安装
eQTpLot 是一个直观且用户友好的 R 包，专为可视化 eQTL 和 GWAS 结果的共定位而开发。eQTpLot 将标准 GWAS 和 eQTL 统计结果以及可选的成对 LD 信息作为输入，以生成一系列图表，可视化给定基因-性状对的 eQTL 和 GWAS 信号之间的共定位、相关性和富集。
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- 每天学习一点点
- 发布于 2024-06-26 16:06
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MITE_Hunter 第六步报错 aln not exits
MITE属于II类非自主转座因子，可以使用MITE_Hunter进行检测，MITE_Hunter的运行一共有8步。 1. 报错信息 在运行第六步（-S 6）的时候出现报错： 2. 报错原因 发现第六步执行： 在MITE_...
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- Ti Amo
- 发布于 2024-08-05 10:36
- 阅读 ( 402 )
