代谢组数据上传NGDC!简单又快捷!

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  • 安生水
  • 发布于 2024-01-30 17:59
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R语言按列合并文件,并保持其中一个文件的原有顺序

1.join函数;2.创建新的顺序变量;3.inner_join函数

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  • 星莓
  • 发布于 2024-01-30 17:49
  • 阅读 ( 1558 )

CLUMPAK安装

CLUMPAK这个软件很古老,安装起来也很麻烦,记录一下https://tau.evolseq.net/clumpak/download/CLUMPAK.zip 安装包下载路径解压以后添加库的位置到环境 export PERL5LIB=path/CLUMPAK:$PERL5LI...

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  • xun
  • 发布于 2024-01-26 17:02
  • 阅读 ( 1059 )

桑基图绘制

桑基图是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,因1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey绘制的“蒸汽机的能源效率图”而闻名,此后便以其名字命名为“桑基图”。...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-23 17:49
  • 阅读 ( 959 )

blast 中的e-value值如何理解?

对e-value值的by chance 进行解释

topGO报错

在r包topgo里面绘制node图的函数是showSigOfNodes(),其中提供的第二个参数不能有0,否则会报错: showSigOfNodes()拆分之后是: sampleGOdata和score(resultKS.elim)是提供给函数的       ...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-22 11:51
  • 阅读 ( 992 )

扩增子序列直接物种注释代码

扩增子单条序列注释 汇总代码如下 import rewith...

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  • xun
  • 发布于 2024-01-22 11:23
  • 阅读 ( 918 )

rMATS turbo使用

rMATS turbo使用

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  • 安生水
  • 发布于 2024-01-17 11:30
  • 阅读 ( 1497 )

R语言使用ggraph绘图导出pdf报错——“invalid font type”

使用ggraph绘图,在结果导出pdf的时候报错,不可用的字体类型“invalid font type” 如果继续使用ggsave导出,可以直接载入字体: library(showtext) font_add('Times','/Library/Fonts/T...

seqcluster软件安装

seqcluster软件安装

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  • 安生水
  • 发布于 2024-01-10 13:38
  • 阅读 ( 1002 )

超快的文件传输软件trzsz

对于服务器而言,和本地的文件互相传输是家常便饭,scp虽然快速,但是毕竟要打很多字,有点麻烦,lrzsz十多年没跟新了,所以我推荐了这个软件trzsz用法和lrzsz差不多,也有额外的功能,有需要自己看帮助...

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  • xun
  • 发布于 2024-01-09 10:56
  • 阅读 ( 1025 )

Rna-seq 去除批次效应ComBat-seq

ComBat-seq

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-01-09 10:54
  • 阅读 ( 1385 )

ftp链接登陆下载文件

我们进行文件下载的时候通常可以直接通过网页的download或者是服务器的wget命令,但是是一个需要登陆的ftp地址,这两个方法就不太适用了,本文提供给大家一些ftp地址的登陆方法。 1. 个人电...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-08 10:41
  • 阅读 ( 1032 )

sort -V | 对字符和数值组合的排序

sort命令有很多选项参数,其中-n选项可以对文件内容进行数字排序。但是当想排序的列是由字符和数字组成的时候,这个选项就不能达到想要的效果。 1.例如,对某个文件列进行排序: #cat 1.txt11...

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  • rzx
  • 发布于 2024-01-05 13:28
  • 阅读 ( 1122 )

LTR_HARVEST的并行软件LTR_HARVEST_parallel

在对基因组进行评估的时候,LAI是连贯性完整性的指标之一。目前经常使用的计算 LAI 的软件是 LTR_retriever,他并非是一个单一的工具,而是通过整合多个LTR预测软件的结果,过滤其中的假阳性LTR...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-04 14:29
  • 阅读 ( 2070 )

使用compare_means()t.test进行显著性检验时报错

compare_means()函数进行t.test时报错——“not enough 'x' observation”

BaiduPCS-Go上传经常出错

使用BaiduPCS-Go上传文件经常出现错误,检查一下版本 直接使用软件自带的不一定下载成功 ,所以手动下载一下,这个版本直接解压就行,有需要的可以下一下,不需要编译了, BaiduPCS-Go-v3.9.5-li...

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  • xun
  • 发布于 2024-01-02 15:54
  • 阅读 ( 865 )

借助perl脚本进行文件整理 | 将按第一列信息整理的文件改成按照第二列信息整理

perl data.pl id1.txt id2.txt 现有一文件,有两列,是按照第一列内容进行展示的,如下图:A    green;red;blueB    yellow;greenC    red;blue;grey;pink;blankD    green;grey现在想将文件...

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  • rzx
  • 发布于 2023-12-28 15:32
  • 阅读 ( 962 )