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GATK 4.4.0报错“ A JNI error has occurred, please check your installation and try again”

报错在利用GATK进行markdup和variant calling的时候出现报错：报错的主要信息用红框框出了，错误信息是：错误为发生JNI错误，请检查安装并重试。出现报错的原因： 1. javac与java版本...

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Ti Amo
发布于 2024-03-25 11:54
阅读 ( 1263 )

R语言-文件行名重复，对行名重命名

R语言对重复的行名进行重命名操作

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每天学习一点点
发布于 2024-03-25 10:29
阅读 ( 1504 )

windows安装Aspera Connect软件

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安生水
发布于 2024-03-22 17:29
阅读 ( 3025 )

illumina平台转录组299/样品，组学大讲堂学员专属福利！速来报名吧！

转录组测序冰点价格，百万让利！

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生信老顽童
发布于 2024-03-19 17:54
阅读 ( 1592 )

在Windows系统中安装并使用seqkit工具

seqkit软件介绍： Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件，由go语言编写，功能比较完善，软件使用也很稳定。下载链接：https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式： 1. 点...

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rzx
发布于 2024-03-19 17:01
阅读 ( 2394 )

bcftools创建vcf索引失败

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安生水
发布于 2024-03-18 13:44
阅读 ( 1009 )

遗传图谱中各种作图群体介绍

基因定位在动植物研究中非常重要，利用遗传图谱很多科学家定位了重要作物的重要农艺性状，例如克隆水稻分蘖基因 MOC1 的李家洋院士团队，克隆了水稻粒重基因 GW2 的林鸿宣院士团队……，还有数以...

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omicsgene
发布于 2024-03-14 18:05
阅读 ( 4482 )

GFF或GTF格式转bed

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安生水
发布于 2024-03-14 14:02
阅读 ( 1509 )

不同物种基因组之间的比对与可视化

基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较，以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...

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Ti Amo
发布于 2024-03-13 15:15
阅读 ( 4942 )

不同物种基因组之间的比对与可视化

基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较，以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...

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Ti Amo
发布于 2024-03-13 15:14
阅读 ( 1811 )

Linux重定向以及nohup不输出的方法

在Linux中，0、1和2分别代表标准输入（stdin）、标准输出（stdout）和标准错误输出（stderr）

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每天学习一点点
发布于 2024-03-13 11:49
阅读 ( 1190 )

使用bcftools文件提取vcf文件子集

1. 准备好要提取的染色体及位置信息文件id.list。文件示例如下： Chr1 11787600 11793521Chr1 30028805 30042382Chr1 54966087 54970283Chr1 57228272 ...

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rzx
发布于 2024-03-11 18:13
阅读 ( 4158 )

qiime自带的alpha_diversity.py脚本报错

alpha_diversity.py -i some.biom -m observed_species,shannon,chao1,simpson,ace,goods_coverage 在运行时报错 File "/share/work/biosoft/python/Python-v2.7.11/lib/python2.7/site-p...

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xun
发布于 2024-03-11 09:43
阅读 ( 967 )

TukeyHSD报错

Error in TukeyHSD.aov(., ...) : no factors in the fitted model Calls: %>% ... is.data.frame -> <Anonymous> -> TukeyHSD -> TukeyHSD.aov In addition: Warning mess...

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xun
发布于 2024-03-08 10:16
阅读 ( 962 )

HISAT2比对时报错|(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL)

我有12个样本在进行HISAT2比对时有3个样本出现报错(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL) 运行脚本： hisat2 -p 10 --rg-id=L2 --rg SM:L2 --rg LB:L2 --rg PL:ILLUMINA -x iwgsc_re...