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TCGA数据发表5分文章

TCGA的一篇五分文章

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-06 17:22
  • 阅读 ( 6278 )

GEOquery 读取本地表达矩阵压缩包

利用GEOquery包的getGEO()可以进行芯片相关数据的下载,不过,有人反映不少芯片的表达矩阵下载经常出错,可以通过手动下载的方式将矩阵文件下载到对应的工作路径中: 矩阵文件的基本命名格式...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-06 16:00
  • 阅读 ( 9731 )

blast报错

在刚开始按官网教程(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279680/)学习使用blast时,经常会遇到程序报错

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 15:00
  • 阅读 ( 11932 )

BLAST+使用方法

BLAST+是使用非常广泛的序列比对软件,有NCBI提供

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:36
  • 阅读 ( 6718 )

dcaps标记设计软件——SNP_Primer_Pipeline

之前在做dcaps标记,开始只找到网站版的软件,后来发现一个不错的脚本软件——SNP_Primer_Pipeline

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-06 14:21
  • 阅读 ( 6222 )

手把手教你使用GSEA分析!

准备好分析需要的文件,在GSEA官网下载分析软件(软件可以免费下载,需要配置java环境)就可以进行GSEA分析。 打开分析软件,第一步是载入数据,如下图所示,点击红箭头指向的1出的Load data会...

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  • landy
  • 发布于 2018-07-06 12:53
  • 阅读 ( 9985 )

TCGA中转录因子的调控分析

转录因子在TCGA中的调控分析

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-06 12:05
  • 阅读 ( 4489 )

TF的结合序列查找

转录因子的结合序列查找

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-06 11:07
  • 阅读 ( 4371 )

小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具

文章投稿,除了文好当然还要“颜好”!在这个看脸的世界,为了给文章加分,各位老师学生也是做足功课了!但是不会编程敲代码?——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-06 09:07
  • 阅读 ( 13755 )

常见的OrgDB包,方便对应物种注释

列举了19个OrgDB,物种对应的全基因组注释R包,方便根据EntreZ进行基因的注释分析等等 物种 OrgDB 按蚊(Anopheles) org.Ag.eg.db 拟南芥(Arabidopsis) org.At.tair.db 牛(Brov...

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-05 22:47
  • 阅读 ( 18210 )

DNA SequenceLogo

快速绘制DNA Logo

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-07-05 22:39
  • 阅读 ( 3738 )

biolinux共享目录文件夹建立及注意事项

biolinux共享目录创建及注意事项。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-05 18:38
  • 阅读 ( 10837 )

R语言绘制维恩图空值NA处理

行数不同的数据读入R,批量去除NA,绘制韦恩图。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-05 16:16
  • 阅读 ( 8493 )

基因ID 转换

生物信息学 基因 ID 转换

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-05 16:08
  • 阅读 ( 5902 )

Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色

Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-04 12:02
  • 阅读 ( 9166 )

统计不同分组差异表达结果并统计上下调基因数目并绘制柱状图

R统计不同差异组合,上下调基因个数;并用ggplot2绘制柱状图。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-03 14:02
  • 阅读 ( 11614 )

R语言统计相同ID出现的频率并用ggplot2绘制柱状图

统计相同ID出现的频率,并用ggplot绘制柱状图;

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-01 15:46
  • 阅读 ( 9066 )

R语言统计数据范围并用ggplot2绘制柱状图

R语言,按数值范围统计频次,绘制柱状图

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-01 15:33
  • 阅读 ( 8891 )

R语言统计数据范围并用ggplot2绘制饼图

按范围统计数值分布,并用ggplot2绘制饼图;

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-01 15:22
  • 阅读 ( 8422 )