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linux命令如何对两个文件去重复
例如你有两个基因id文件，你想知道这两个文件共有的id，怎末办呢？一行命令就可以解决。cat 文件1 文件1 |sort|uniq 输出的就是这两个文件的并集cat 文件1 文件1 |sort|uniq ...
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- landy
- 发布于 2018-05-11 13:54
- 阅读 ( 2523 )
landy
如何快速获取多条序列长度信息
如何快速知道你的多个序列的长度呢？这里还是分享一个虚拟机的bio-linux的工具，samtools。命令行格式：samtools faidx xulie.fa(你的序列文件)结果会生成一个 xulie.fa.fai文件，也是就是在...
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- landy
- 发布于 2018-05-11 11:31
- 阅读 ( 3552 )
如何将基因组的注释文件gff转化成基因的注释文件gtf
在做分析的时候，有时候我们需要将gff文件转化为gtf，如何转化呢？ 这里有一个小工具，虚拟机的bio-linux自带不需要安装，就是gffread： 命令行格式：gffread gff文件 -T -o gtf文件，...
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- landy
- 发布于 2018-05-11 10:55
- 阅读 ( 6385 )
安生水
Perl提取染色体序列指定范围的基因序列
Perl提取指定位置的基因序列用到 substr 函数，用法： $gene = substr( $fasta,$start-1, $end - $start+1); 其中$fasta是总的序列；$start是提取序列的开始位置，由于Perl字符串是从0计数的...
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- 安生水
- 发布于 2018-05-09 16:27
- 阅读 ( 4253 )
pfam上不去 打开后搜索没有反应
pfam打开不了解决办法，Pfam这个主页里，这些搜索项目点击没有反应，是咋回事呢
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- omicsgene
- 发布于 2018-05-09 08:33
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基因家族分析--低成本SCI文章思路
生物信息发展迅猛，公共数据库中存放着海量的数据，如何利用这些公共数据结合自己的实验发一篇SCI？基因家族分析无疑是个低投入、高产出的好选择。今天我们就拿2018年发表的一篇文献跟大家聊...
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- landy
- 发布于 2018-05-07 15:07
- 阅读 ( 14333 )
