利用NCBI和Pfam数据库查找基因家族保守结构域相关信息

相近功能基因的检索方法，如何利用pfam数据库下载隐马尔科夫hmm文件。

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• landy
• 发布于 2018-04-23 14:05
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群体遗传进化分析用MEGA

MEGA进行遗传进化分析，揭示不同种群间遗传进化关系和环境适应性机制。

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• Daitoue
• 发布于 2018-04-23 09:39
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Linux生物信息分析环境搭建

想做生物信息分析，但不知道怎么入门？先来搭个环境吧！想分析数据，但是分析不了？先来搭个环境啊！搭建好环境，后面的自然就简单多了。 我们平时大都会使用Windows，而很少使用Linux，然而做...

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• 安生水
• 发布于 2018-04-22 23:08
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转录组如何与其他实验手段结合？（第二篇文献）

同一个转录组数据多篇文章，转录组如何结合其他实验手段！好文难得！

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• 红橙子
• 发布于 2018-04-22 22:49
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转录组+sRNA+降解组=7分文章

三种测序数据进行联合分析，以期揭示东南景天在Cd胁迫下的植物修复过程中的调控网络

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• Daitoue
• 发布于 2018-04-22 22:12
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PBJ：转录组揭示植物中磷再转运的分子机制

只要找对了研究方向，做好充分的调研准备，即便是常规的实验技术，一样能够发高分文章。

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• Daitoue
• 发布于 2018-04-22 22:00
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茶树在非生物胁迫下的转录响应

非生物胁迫下耐受性植物 转录组实验的典型研究思路。

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• Daitoue
• 发布于 2018-04-22 21:49
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RNA-seq发文必备技能——GEO数据库上传

使用转录组数据发文章必备技能——教你轻松搞定GEO数据上传。

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• Daitoue
• 发布于 2018-04-22 21:44
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OTU互作网络分析用MENA

MENA，一个可以利用OTU数据进行在线分子生态网络分析的网站，帮你搞定OTU互作网络图。

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• Daitoue
• 发布于 2018-04-22 21:19
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获取MOTIF 位置信息矢量图

MEME(Motif-based sequence analysis tools)大家都很了解，是搜索DNA或者蛋白质的motif常用工具，结果输出一般是有四个文件，motif的图形展示文件（LOGO），txt文本，html的网页信息文件及xml...

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• landy
• 发布于 2018-04-22 21:05
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两分钟看懂基因组注释GFF文件

随着大数据时代的到来，很多生物科研工作者都接触了基因组相关实验。在做数据分析的时候，会用到一个很重要的文件，就是基因组的注释文件，也就是今天分享内容的主角GFF文件！ 什么是GFF文件...

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• landy
• 发布于 2018-04-22 21:00
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做进化树，到底哪种算法适合我？

进化树（英语：phylogenetic tree）又称演化树（evolutionary tree），是表明被认为具有共同祖先的各物种间演化关系的树状图。是一种亲缘分支分类方法（cladogram）。在图中，每个节点代表其...

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• landy
• 发布于 2018-04-22 20:56
• 阅读 ( 5793 )

一键搞定批量序列提取TBtools！

用基因ID提取其序列很简单，ctrl+F找到ID对应的序列，ctrl+C、ctrl+V就好了，少量基因的还OK，但是如果有几百个甚至上千个ID,手指会不会很酸爽？ 这里墙裂推荐一个软件，功能很强大，就是TBtoo...

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• landy
• 发布于 2018-04-22 19:08
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分分钟教你绘制基因结构图！GSDS

今天介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server，简单好用功能还挺强大。运用它能够绘制清晰的基因结构，清晰明了地展示外显子、内含子及UTR的位置。还可以联合其他数据绘制...

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• landy
• 发布于 2018-04-22 18:59
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两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图！

使用FigTree制作漂亮的系统发育树。这款软件需要在JAVA环境下运行，所以使用前记得要安装JAVA。  第一步：选择合适的树形 使用File – open 打开树文件（一般为.nwk文件），在左上方绿色...

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• landy
• 发布于 2018-04-22 18:38
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病毒衍生的small RNAs： 宿主与病毒互作的分子“证据”

    病毒是专性寄生，需要借助宿主才能进行复制，繁殖。在病毒的复制循环过程中，其RNA中间体可以被宿主的不同抗病毒途径RNA decay、RNA interference、 and RNase L pathways识别并降解，从而...

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• landy
• 发布于 2018-04-22 18:12
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4个样品重测序发PlosOne

4个甜瓜重测序绘制抗白粉变异图谱[1]发PLoS ONE

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• omicsgene
• 发布于 2018-04-22 15:04
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性价比超高5个重测序发IF=6遗传进化文章

混池测序做遗传进化，分析受选择基因

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• omicsgene
• 发布于 2018-04-22 15:02
• 阅读 ( 3732 )

ensembl和NCBI基因组下载，基因序列下载查看

参考基因组下载，Ensembl，NCBI，JGI等网站下载使用，可视化浏览,基因查看与下载等；

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• omicsgene
• 发布于 2018-04-22 14:59
• 阅读 ( 43114 )

低成本转录组跨种遗传进化分析

金蕨属转录组遗传进化分析

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• omicsgene
• 发布于 2018-04-22 14:52
• 阅读 ( 5192 )