TGS-gapcloser 安装与使用

基因组组装过程中会得到草图的scaffold,需要进一步进行gaps的关闭。TGS-gapcloser 是华大基因开发的,一个利用其他组装或是长度长测序数据对草图进行gap填充的一款软件。

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 2023-10-30 17:19
  • 阅读 ( 2440 )

Linux join命令合并文件

Linux join命令合并文件

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2023-10-30 14:37
  • 阅读 ( 1092 )

qiime2 q2-picrust2 报错问题

qiime2 q2-picrust2 报错问题

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-30 13:21
  • 阅读 ( 920 )

Unicycler二代、三代混合组装

  • 0
  • 0
  • 星莓
  • 发布于 2023-10-26 14:31
  • 阅读 ( 1520 )

离子交换色谱步骤及作用

离子交换层析(IEX)是一种主要基于蛋白净电荷的色谱分离方法,通常用于追踪脱酰胺和琥珀酰亚胺的形成。IEX有两种类型:阳离子交换和阴离子交换层析法。当缓冲液pH值高于此IP时,蛋白带负电(阴离子);当pH值低于此IP时,蛋白带正电(阳离子)。下面主要介绍离子交换色谱操作中应注意的一些具体问题。

全能核酸酶SuperNucleaseFAQ详解:解开核酸酶的神秘面纱

义翘神州提供不同级别全能核酸酶,GMP级条件下生产的全能核酸酶SuperNuclease,无动物源性,可高效降解单链、双链、线性、环状、超螺旋等任何形式的DNA及RNA。超高活性,应用场景广泛且使用量低不易残留,质量、性能、供货能力可靠,并已完成在FDA的药物主文件申报备案(DMF Number#:35978),满足药物申报的规范。

RagTag:同源锚定延伸

RagTag是一个集合功能的软件可以用来构建scaffold、提升基因组组装质量

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 2023-10-25 13:35
  • 阅读 ( 1443 )

简单的数据处理代码

代码分享

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2023-10-25 11:54
  • 阅读 ( 803 )

绘制HIC热图

绘制HIC热图

  • 1
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2023-10-25 10:42
  • 阅读 ( 2469 )

使用grep函数判断数组元素的有无

grep函数的使用: grep (/EXPR/, @array) #其中EXPR表示需要匹配内容的正则表达式,@array表示待匹配的数组,反向匹配使用grep (!/EXPR/,@array) 若使用标量接收返回结果,返回值为匹配的次...

抗体Fab段的主要功能及制备方法

抗体是一种由B淋巴细胞或浆细胞产生的免疫球蛋白,它在人体免疫系统中扮演着重要的角色。抗体能够识别并结合抗原,从而启动补体级联反应或通过Fc段与效应细胞结合,引发免疫应答。抗体由轻链(L)和重链(H)组成,每条链都分为恒定区(C)和可变区(V)。可变区(V)负责识别和结合抗原,恒定区(C)则与抗体的效应功能相关。其中,Fab段是抗体的抗原结合片段,具有高亲和力和特异性,是抗体发挥生物学功能的重要部分。

蛋白纯化过程中的七大常见问题详解

重组蛋白的纯化是生物学研究中的重要技术。为了研究蛋白的特定功能和结构,研究人员必须将重组蛋白从生物体中分离并纯化。蛋白纯化方法主要利用不同重组蛋白之间的相似性和差异性。可以根据蛋白之间的相似性去除非蛋白物质,然后根据蛋白之间的差异分离纯化目标重组蛋白。在蛋白纯化的过程中,我们可能会遇到一些问题。让我们一起来看看这些问题,并探讨相应的解决方案吧!

PICRUSt2扩增子功能预测与差异比较分析

PICRUSt2扩增子功能预测与差异比较分析

  • 1
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-24 11:42
  • 阅读 ( 2928 )

CAR-NK疗法:优势详解与应用前景

CAR-NK细胞疗法作为新型治疗方案,能够克服CAR-T细胞疗法的局限性,如治疗诱导的不良反应。CAR-NK细胞比记忆T细胞和未转导的NK细胞表现出更高的细胞溶解活性;因此,杀伤肿瘤细胞的效果更佳。目前,全球有800多项CAR-T和28项CAR-NK正在开展临床试验。

CAR-T疗法:综合概述及临床应用

CAR-T疗法就是嵌合抗原受体T细胞免疫疗法,英文全称Chimeric Antigen Receptor T-Cell Immunotherapy。这是一种治疗肿瘤的新型精准靶向疗法,近几年通过优化改良在临床肿瘤治疗上取得很好的效果,是一种非常有前景的,能够精准、快速、高效,且有可能治愈癌症的新型肿瘤免疫治疗方法。

Bowtie2使用方法与参数详细介绍

对参考序列构建indexbowtie2-build genome.fasta index尝试使用前10000个reads进行比对bowtie2 -u 10000 -p 8 -x index -1reads1.fq -2 reads2.fq -S out.sam使用8个线程进行比对bowtie2 -p 8...

  • 0
  • 0
  • rzx
  • 发布于 2023-10-18 17:58
  • 阅读 ( 2022 )

picrust1 16S 微生物功能预测

picrust 16S 微生物功能预测

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-18 15:16
  • 阅读 ( 838 )

lefse 运行报错python3中

lefse 运行报错python3中

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-18 14:38
  • 阅读 ( 1149 )

siRNA

什么是siRNA ? siRNA(small interfering RNA 小干扰RNA) 是由 20-25 个核苷酸组成的双链 RNA 分子。一般3’端有两个游离的碱基,通过RNA干扰途径沉默目标基因。 RNA干扰(RNAi) 在RNA干扰...

  • 0
  • 0
  • rzx
  • 发布于 2023-10-18 14:16
  • 阅读 ( 941 )

近期常用命令记录——比对并提取fq,ncbi下载并转化为fq,序列提取等

记录近期常用命令

  • 0
  • 0
  • 星莓
  • 发布于 2023-10-18 13:37
  • 阅读 ( 1150 )