三代组装软件Flye安装及使用
在运行R脚本的时候,出现报错,提示CMplot这个包连接超时。 Error in file(filename, "r", encoding = encoding) : cannot open the connection to 'https://raw.githubusercontent.com/YinLi...
grep是一个常用的文本搜索工具,用于在文件中查找文本字符串。grep--color=auto是grep的一个扩展选项,主要功能是匹配的特定字符串加上颜色以区分,并可以进行高亮显示。可以方便我们快速查找相...
Seqtk工具地址:https://github.com/lh3/seqtk Seqtk工具命令: 操作举例: 01. 将FASTQ格式文件转换成FASTA格式; seqtk seq -a in.fq.gz > out.fa 02. 将FASTQ(Illumina 1.3+)格式...
Rush(Rapid Utilities SHell)是一款强大的并行任务执行工具,专门设计用于在Linux或Unix环境中进行批处理任务。该工具的设计初衷是为了使并行处理和任务管理变得更为简洁明了,同时具备灵活性...
Linux环境下从百度网盘上传、下载数据 bypy upload -v
在前一篇文章里写了使用OthroFinder软件构建物种同源基因分析的工作原理的介绍,这次就利用Orthofinder结果中的数据来绘制物种系统发育树(Phylogenetic tree)。 在Orthofinder结果文件中有一...
外源插入流程报错运行不了
Orthofinder是做直系同源基因分析时常用软件,除此之外,还可以使用OrthoMCL,今天主要介绍Orthofinder软件的工作流程。 1. Orthofinder发表的工作流程如上图: 1.1 (a)将所有物种的...
VCF 是一种常用的生物信息学文件格式,用于存储基因组中的遗传变异数据,特别是单核苷酸多态性(SNP)和小插入/缺失(Indel)等变异。 VCF 文件通常由文本格式组成,可以用文本编辑器进行查看...
在linux中执行命令的时候,在程序命令行后加入&符,可以将命令放入后台执行且关闭shell不退出进程; 但如果一开始执行命令的时候没有加入&,后面发现命令执行时间很长,解决办法如下:...
再用hifiasm组装基因组时,线程数选择的100,但是后台只看见了10,这是怎么回事?docker会限制线程数吗?
安装gdal报错
ANNOVAR 基于gff中基因的位置简单注释
ggplot 柱状图,y轴从0 开始,最高柱子 留有余地代码:
有时候我们从NCBI下载SRA文件时会发现,会有SRA Lite和SRA Normalized两种类型的数据,前者后缀是.sralite,其文件大小也比原始的SRA文件要小。这两种数据的区别是什么呢?
R安装units包报错解决方法
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CSVTK,即CSV工具包,是一个用于处理逗号分隔值(CSV)文件的实用命令行程序。由于其简单性、灵活性和效率,对于经常处理CSV文件的人来说,特别是在数据科学、生物信息学以及任何需要数据分析的...
umount -l /home 强行解除挂载