全部 - 文章 - 第22页 - 组学大讲堂问答社区

nfs的一个缺陷

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omicsgene
发布于 2023-06-06 21:17
阅读 ( 6697 )

运行命令makeblastdb建库时报错，生成pdb-lock 空文件。

运行命令makeblastdb -in all.pep.fa -dbtype prot -title all.pep.fa 时卡住报错，生成all.pep.fa.pdb-lock 空文件。解决：makeblastdb 工具版本问题，从2.13.0版本改成2.6.0版本，就可以...

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rzx
发布于 2023-06-05 15:20
阅读 ( 1334 )

bedtools 对bed 文件进行排序

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安生水
发布于 2023-06-05 11:35
阅读 ( 2389 )

kraken2生成的biom文件处理

使用kraken2软件做宏基因组或扩增子项目物种注释项目的时候，如果后续不使用bracken则可能会遇到一个问题，结果生成的biom文件中taxonomy并不是最终结果，比如下面这样可以用脚本来处理，删...

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xun
发布于 2023-05-31 17:33
阅读 ( 1382 )

多分组venn图绘制脚本

绘制多分组venn图时发现好多包都不支持，只能用原始的包，脚本如下 #!/share/work/biosoft/R/latest/bin/Rscriptargs <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)library(venn)library(VennDiagra...

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xun
发布于 2023-05-30 18:05
阅读 ( 1220 )

blastn使用教程及结果详解

BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) 是我们常用的短序列比对工具，直接输入fasta格式的序列文件就可进行比对

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星莓
发布于 2023-05-29 14:49
阅读 ( 5484 )

计算RNASeq 的Power值

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安生水
发布于 2023-05-29 13:25
阅读 ( 2013 )

dell R430启动失败 NVRAM_CLR jumper

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omicsgene
发布于 2023-05-27 12:33
阅读 ( 1161 )

空间代谢组学|质谱成像技术原理解读

空间代谢组学（Spatial Metabolomics）是整合质谱成像（Mass Spectrometry Imaging，MSI）和代谢组学（Metabolomics）技术，对动/植物组织中代谢物的种类、含量和空间分布进行精准测定的技术，...

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rzx
发布于 2023-05-19 15:48
阅读 ( 3054 )

构建一致性序列

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安生水
发布于 2023-05-19 11:33
阅读 ( 5955 )

linux设置磁盘自动挂载

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omicsgene
发布于 2023-05-17 17:06
阅读 ( 1268 )

bam文件格式详解

BAM就是SAM的二进制文件，具有更小的存储空间，并且许多下游分析工具使用的是BAM格式。

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星莓
发布于 2023-05-16 10:00
阅读 ( 6751 )

python2运行lefse软件的时候报错

使用python2运行lefse软件的时候报错这是因为当前LEfSe依赖的R包rpy2的版本与你的R版本不兼容，你可以尝试更新一个rpy2的小版本，比如我更新了 pip2 install rpy2==2.8.6 随后就可以直接使用...

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xun
发布于 2023-05-12 18:06
阅读 ( 790 )

综合转录组学和代谢组学分析揭示了菜豆响应冷胁迫的关键调控网络

文章链接：https://bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12870-023-04094-1 一、实验样本准备实验物种：冷敏感菜豆品种093和抗冷菜豆品种120材料处理：将所有菜豆种子在25° 日...

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rzx
发布于 2023-05-12 16:05
阅读 ( 1125 )

linux常用技巧

1，备份家目录 #!/bin/bashBACKUP_DIR=/share/nas5/wanghj/dataTIMESTAMP=$(date +%Y%m%d%H%M%S)tar -zcvf $BACKUP_DIR/backup_$TIMESTAMP.tar.gz /home/wanghj 2，监控系统内存，i/o及存储等...