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conda一直卡在Solving environment

在使用conda安装CARD数据库自带软件rgi的时候，发现一直卡在Solving environment这一步，查了不少攻略也没能解决问题， 结果换了mamba后瞬间就安装上了，安装非常方便 conda install mamba -c...

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  • xun
  • 发布于 2023-04-06 16:37
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stack的利用

Python中可以使用栈（stack）数据结构来分析数据。下面是一个使用栈来判断一个字符串中的括号是否匹配的例子： 在这个例子中，我们首先定义了一个空的栈（stack），然后遍历字符串中的每一个...

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  • 发布于 2023-04-06 15:59
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解决基因组当中蛋白质序列ID和gff中ID不一致的问题

解决基因组当中蛋白质序列ID和gff中ID不一致的问题

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-04-06 09:38
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linux使用ossutil下载阿里云数据

linux使用ossutil下载阿里云数据

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-31 16:30
  • 阅读 ( 3246 )

pophelper包安装

pophelper包安装

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-30 10:10
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wgd syn 报错 KeyError: 6.0

KeyError: 6.0

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-29 19:19
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VI、VIM用什么命令跳到文件头和文件尾

VI、VIM用什么命令跳到文件头和文件尾

dQTL.seq方法研究基因定位

dQTG.seq方法包含dQTG.seq1、dQTG.seq2、smoothLOD、C'、Δsnp index、ED六种计算方法。 其中dQTG-seq1方法利用F2群体极端池标记等位基因数目来预测其基因型数目，通过观测的标记等位基因数目和...

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  • rzx
  • 发布于 2023-03-29 11:56
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R语言数据整理——tidyr包

tidyr主要提供了一个类似Excel中数据透视表(pivot table)的功能 tidyr包主要涉及： 1)长宽数据转换；2)列分割与列合并；3)缺失值的简单补齐

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-24 15:57
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怎样画多物种基因家族共线性分析图？

基因家族共线性分析，利用python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

Linux单行命令

对文本文件做集合交、并、差运算时可以使用sort和uniq awk常用命令 awk '{ sum += $2 } END { print sum }' myfile        #这个命令将计算myfile文件的第二列的总和并打印出来。awk '{ p...

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  • xun
  • 发布于 2023-03-22 13:13
  • 阅读 ( 837 )

基因组注释流程，PASA mysql 数据库启动 exited

基因组注释流程，PASA mysql 数据库启动 exited

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  • 发布于 2023-03-21 18:03
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Docker 使用容器来创建更新镜像

Docker 使用容器来创建镜像

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-20 20:51
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【Linux】查看文件中的某几行（中间几行）

【Linux】查看文件中的某几行（中间几行）

Rocky 9.0(Centos 9)服务器安装

Rocky 9.0(Centos 9)服务器安装

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-20 13:24
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linux无法自动启动

解决linux无法自动启动

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-16 11:20
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R语言用tidyr包进行长宽数据转换

长型和宽型数据在数据分析中非常常见。 之前我们进行长宽数据转换使用较多的包是reshape或reshape2，原作者新推出的tidyr包对数据整合更加优秀，让我们一起来学习一下如何使用tidyr包进行长宽数据转换。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-15 18:06
  • 阅读 ( 2260 )

Gene ID、Gene Symbol、UniProtKB等ID的转换你会么？

我们在做数据分析时，经常会遇到不同数据库的基因ID不统一的情况，为了方便后续的数据分析，需要进行基因ID或者名称之间的转换。今天小编就给大家介绍几个在线转换的网站。 Uniprot基因ID/名称...

基因家族共线性分析，利用python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

基因家族扩张或收缩，利用python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

OrthoFinder 输出结果文件说明

OrthoFinder 输出结果文件说明

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-13 14:12
  • 阅读 ( 4099 )