全部 - 文章 - 第28页 - 组学大讲堂问答社区

O2PLS-DA分析

两组学数据的正交偏最小二乘法判别分析（2-way orthogonal Partial Least Square with Discriminant Analysis ） O2PLS 模型用于两个数据组间的整合分析，包括系统生物学组学间关联、分子调控...

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rzx
发布于 2022-12-19 14:20
阅读 ( 3751 )

ggforestplot error: Error in assertAndRetrieveTidyValue(x, mean) : argument "x" is missing, with no default

使用ggforestplot绘制森林图时，有时候会报如标题所示的错误实际上，这不一定是因为缺失参数，也有可能是因为加载了forestplot包，这两者的语法存在交叉，所以如果同时加载，就可能出现错误，...

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xun
发布于 2022-12-19 13:42
阅读 ( 1734 )

linux 常用的解压命令

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生信阿姨
发布于 2022-12-19 11:46
阅读 ( 858 )

CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'

使用conda时报上面的错，一般是因为路径错误使用这个命令获取路径 conda info | grep -i 'base environment' 用得到的路径替换下面命令中的路径 source 路径/etc/profile.d/conda.sh 运...

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xun
发布于 2022-12-19 11:20
阅读 ( 1462 )

GenomicsDBImport 的多样本变异检测

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安生水
发布于 2022-12-19 10:59
阅读 ( 3066 )

ERROR 1290 (HY000): The MySQL server is running with the --skip-grant-tables 解决方法

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安生水
发布于 2022-12-12 14:49
阅读 ( 1722 )

pfam数据库被合并之后，还有很多数据库可以进行结构域的查询

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生信阿姨
发布于 2022-12-09 18:19
阅读 ( 1489 )

零假设与备择假设

零假设（null hypothesis），统计学术语，又称原假设，指进行统计检验时预先建立的假设，这个假设一般是未进行实验之前最保守和有意推翻的假设，而之后实验的目的一般是希望证明其假设错误。零...

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rzx
发布于 2022-12-09 15:23
阅读 ( 4295 )

NCBI下载SRR并转换为fastq文件

想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据，看了一些下载教程，方法各异，看完思路还是不清晰，以下记录我的操作步骤，仅供参考

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星莓
发布于 2022-12-09 11:56
阅读 ( 10532 )

repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件，可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽

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omicsgene
发布于 2022-12-07 10:13
阅读 ( 2365 )

pip报错

出现报错WARNING: Running pip as the 'root' user can result in broken permissions and conflicting behaviour with the system package manager. It is recommended to use a virtual envir...

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xun
发布于 2022-12-05 16:42
阅读 ( 2973 )

NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta，gff3，gtf，gb文件等

NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta，gff3，gtf，gb文件，以及获得细胞器基因组的全部基因名称

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星莓
发布于 2022-12-05 14:58
阅读 ( 8909 )

mysql启动时报错：error while loading shared libraries: libncurses.so.5: cannot open shared object file

mysql启动时报错

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安生水
发布于 2022-12-05 14:14
阅读 ( 1860 )

MySQL报错：ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock'

MySQL报错：ERROR 2002 (HY000)

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安生水
发布于 2022-12-05 14:09
阅读 ( 2334 )

添加千位分隔符

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安生水
发布于 2022-12-05 14:02
阅读 ( 1355 )

interpro 查询结构域

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生信阿姨
发布于 2022-12-01 13:14
阅读 ( 4060 )

超大基因组，超长染色体，凤丹牡丹基因组怎一个难字了得！

上海辰山植物园联合中科院植物研究所、中科院分子植物卓越中心在NC发文公布凤丹牡丹基因组及其关键性状的分子基础！

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omics007
发布于 2022-11-30 15:10
阅读 ( 2575 )

真菌 ncRNA 基因特征及坚定方法

Haas BJ, Zeng Q, Pearson MD, Cuomo CA, Wortman JR. Approaches to Fungal Genome Annotation. Mycology. 2011 Oct 3;2(3):118-141. doi: 10.1080/21501203.2011.606851. PMID: 22059117; PMCID: PMC3207268.