blastp -query unknown.pep.fa -db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta -num_threads 10 -evalue 0.000001 -seg yes -soft_masking true -lcase_masking -max_hsps 1...
Pheatmap绘制多分组热图
seqkit是一个序列处理神器,有统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等功能。 seqkit 一共有37个可用的命令,详细内容如下
组学大讲堂云共享服务器上线!
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Mac使用FileZilla连接服务器-SSH
eggnog-mapper 注释
duplicate_gene_classifier属于MCScanX的核心程序,用于基因分类,统计全基因组不同类型复制事件的数目。 命令行格式: $duplicate_gene_classifier Dl Dl是物种缩写,是Dl.blast文件。在运...
Linux磁盘配额
ggtern 安装报错
训练分类器 Training classifier 因为不同实验的扩增区域不同,鉴定物种分类的精度不同,提前的训练可以让分类结果更准确。在本教程中,使用到的是已经训练好细菌V4区的分类器,可在QIIME2官网...
hmmer之hmmbuild用法
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Rocky 9下Rstudio-service配置教程
pipeline 实现了对全部步骤的流式化封装和管理,可以很方便地使参数集在新数据集上被重复使用。 可以用于下面几处: 模块化 Feature Transform 自动化 Grid Search 自动化 Ensemble Generat...
singularity使用
singularity 利用docker 镜像压缩包构建 sif文件