数据分析
Linux常用命令(目录、文件、权限)——适合新手小白
使用hisat2软件将测序数据比对到基因组
Clustal Omega是欧洲生物信息研究所(EBI)开发的多序列比对排列工具,现已经完全取代了之前ClustalW的地位。最新本的omega比对准确度更高,而且速度更快,适合大规模的多序列比对。
BUSCO评估基因组组装和完整性详解
卡方分布是一种特殊的伽马分布,堪称统计学中应用最广泛的概率分布,很多不需要统计学的行业应该也听说过大名鼎鼎的西格玛分布,也是他的别称。他的泛用毋庸置疑,可非数学出生的计算这个还是颇...
gdc-client 下载TCGA数据 报错 RROR: {"message":"Your token is invalid or expired. Please get a new token from GDC Data Portal."}
linux 利用rename 批量重命名文件
基因组重复序列分类
circos绘圈图时更改字体
在进行iTOL绘制进化树时,需要导入分组圆环或者节点标签的配置文件。最后选择了单个文件上传,在调整好上一圈标签的位置后再导入下一个文件,这样就不会相互影响了。
基因家族,理化性质分析
我们常看到的PCA图中,每个成分都对应了每个特征方差贡献率。通常,求得了PCA降维后的特征向量,我们就可以绘图,但各个维度的方差解释率没有得到,就无法获得PC坐标的百分比。 (文...
解决办法如下 Microsoft Defender Smartscreen 关掉即可下载 接下来是安装 如果遇到Microsoft Defender SmartScreen 阻止了无法识别的应用启动。运行此应用可能会导致你的电脑存在风险。...
在MEGA或其他软件中做序列比对时,往往会有align by muscle和align by clustal W两种方法,那它们有什么区别,使用时怎么选择呢?
TCGA SNV 体细胞突变下载
TCGA 拷贝数变异下载 CNA
docker作为一个虚拟化工具,可以让我们直接使用镜像里面的生信分析软件分析我们的数据,省去安装linux软件的麻烦,对于初学linux的学员非常有用。 我们的《Docker生物信息工具安装与使用》课程...
近日,浙大农学院祝水金团队在Plant Communications杂志发表了题为“A reference-grade genome assembly for Gossypium bickii and insights into its genome evolution and formation of pigmen...
Alternate