在生信分析的过程中绘制热图可以直观呈现多样本多基因的全局表达量变化,也可以呈现多样本或多基因表达量的聚类关系。 而绘制生信热图的方法有很多,常用的有MeV软件、Excel、R语言ggplots绘图...
在阅读文章的时候,我们经常会看到一棵漂亮的进化树,如下图,拟南芥WRKY基因家族的进化树,最外层是基因表达量热图,中层是基因ID,里层为拟南芥基因之间的进化关系,不仅直观地展现了物种的进...
GWAS模型介绍
在线绘制基因染色体位置图
GEMMA软件下载安装
dell R730 清除硬盘数据:
A.txt中大写转换成小写:tr 'A-Z' 'a-z' A.txt >a.txt
下载ICGC数据库中的数据
metascape数据库富集分析
Python中运行时出现SyntaxError报错
混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值
IF=8.78|非肿瘤数据挖掘思路(GWAS Catalog)
在对进化树进行美化时,明明图片显示基因ID,结果导出之后却缺失了标签。 (1)标签的显示由 决定,大家可以通过这个选项来选择结果图中是否显示标签。 (2)但有时候明明图片显示基因ID,结...
R包GSVA富集分析
绘制桑基图(冲击图)
get()、assign()、I()、0-1标准化
epstopdf软件下载安装
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GWAS cFDR 分析
R包mclust对样本进行聚类