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NCBI下载的单细胞数据只有read1和read2如何读入cellranger
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bowtie2 将fasta序列比对到参考基因组
BaiduPCS-Go 无法上传文件的问题
有时候我们需要从tar压缩文件夹中仅提取某个目标文件,如果对整个压缩文件进行解压的话,未免太占用空间和资源,我们可以使用如下命令进行操作
蛋白质比对结果快速分类taxid的c脚本
Linux命令处理文件合并
如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组,然后使用filter函数结合any函数来判断每个分组是否满足特定条件并进行过滤。
MITE属于II类非自主转座因子,可以使用MITE_Hunter进行检测,MITE_Hunter的运行一共有8步。 1. 报错信息 在运行第六步(-S 6)的时候出现报错: 2. 报错原因 发现第六步执行: 在MITE_...
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SCTransform在seuratv4的时候没问题,升级到v5的时候不工作,出现报错 > brain <- SCTransform(rep, assay = "Spatial", verbose = TRUE)Running SCTransform on assay: SpatialRunning SC...
执行降维分析的函数,umpa的时候报错 brain <- RunUMAP(brain, reduction = "pca", dims = 1:30) 报错信息如下: Error in irlba::irlba(L, nv = n, nu = 0, maxit = iters) : function '...
绘制全基因组甲基化图谱
单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)