B细胞分类:
单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE146771)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-癌(NSCLC)(GSE127465)
biom格式的文件如果想要删除某个物种啥的,转换以后直接修改是不行的 先转化成tsv biom convert -i bak/feature_table_tax.biom -o feature_table_tax.tsv --to-tsv --header-key taxonomys l...
单细胞转录组数据挖掘流程记录-肝细胞癌(HCC)(GSE149614)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-UM葡萄膜黑色素瘤(GSE139829)
当使用循环跑R函数的时候,如果其中某一次循环执行时报错,那么就会中断循环体,并在屏幕上打印出报错信息
甲基化水平如何计算
有的文章会在模块化的群落里加上Convex Hull ,类似这样,如何实现呢,可以借助ggforce的geom_mark_hul 比如我们的示例代码稍作修改 library(ggforce) 主要是加了最后一行,的geom_mark_hull...
进化树(Phylogenetic Tree)是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中,每个分支点(节点)代表一个共同祖先,而每个末端的分支(叶节点)代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间,即在进化树上标注时间点,为进化树提供了一个时间框架,便于超度量树的构建
pySCENIC转录因子分析结果解读
我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候,需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包
Mac | Mac M 芯片应用意外退出问题
多个浏览器均无法访问zenodo网站 解决方法: 1. 找到ip:188.185.79.172 查询ip的网址:站长工具 - 站长之家 (chinaz.com) 2. 进入C:\WINDOWS\system32\drivers\etc,修改host权限 3、...
空间转录组简介 空间转录组,顾名思义,是在转录组的基础上加上了空间位置信息。如果不借助空间的技术,我们的转录组一般是粉碎组织到细胞层级或者更低的rna碎片层级,而进行sc RNA或者Bulk...
解决dbplyr和BiocFileCache不兼容导致eQTplot包绘图时报错的问题
单细胞转录组数据挖掘流程记录-CRC直肠癌(GSE178341)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(GSE161529)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107)
单细胞转录组数据挖掘流程记录-BLCA膀胱癌(GSE192575)