sort: write failed: /tmp/sort0JADkd: No space left on device报错
通过已经发表的玉米和大刍草基因组变异数据来计算感兴趣的基因组位置上,是否受到选择。主要是比较大刍草和玉米之间,该区间的多样性是否会下降,如果该区域内SNP的多态性下降,表明该区域内受到了选择。
tassel 跑PCA的时候由于SNP位点太多报错
转录组个性化分析之可变剪切分析工具:rMATS turbo
/share/work/biosoft/tools/distributing_svg_4.74/svg2xxx_release/svg2xxx all.KEGG.svg ./ -dpi 300 Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedOperationException: The Security Ma...
Error: cannot allocate vector of size X Gb 这种问题尤其在32位R版本中常见,因为它们对可用内存有限制。即使在64位版本中,当数据集非常大时也可能遇到内存问题。解决这个问题通常需要优化...
报错 在利用GATK进行markdup和variant calling的时候出现报错: 报错的主要信息用红框框出了,错误信息是:错误为发生JNI错误,请检查安装并重试。 出现报错的原因: 1. javac与java版本...
R语言对重复的行名进行重命名操作
windows安装Aspera Connect软件
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seqkit软件介绍: Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件,由go语言编写,功能比较完善,软件使用也很稳定。 下载链接:https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式: 1. 点...
bcftools创建vcf索引失败
基因定位在动植物研究中非常重要,利用遗传图谱很多科学家定位了重要作物的重要农艺性状,例如克隆水稻分蘖基因 MOC1 的李家洋院士团队,克隆了水稻粒重基因 GW2 的林鸿宣院士团队……,还有数以...
GFF或GTF格式转bed
基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较,以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...
基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较,以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物...
在Linux中,0、1和2分别代表标准输入(stdin)、标准输出(stdout)和标准错误输出(stderr)
1. 准备好要提取的染色体及位置信息文件id.list。文件示例如下: Chr1 11787600 11793521Chr1 30028805 30042382Chr1 54966087 54970283Chr1 57228272 ...
alpha_diversity.py -i some.biom -m observed_species,shannon,chao1,simpson,ace,goods_coverage 在运行时报错 File "/share/work/biosoft/python/Python-v2.7.11/lib/python2.7/site-p...
Error in TukeyHSD.aov(., ...) : no factors in the fitted model Calls: %>% ... is.data.frame -> <Anonymous> -> TukeyHSD -> TukeyHSD.aov In addition: Warning mess...