机器学习预测的混淆矩阵

机器学习混淆矩阵

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• microRNA
• 发布于 2018-12-09 21:12
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转录组中Count, TPM,FPKM如何计算

转录组中Count, TPM,FPKM如何计算

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• microRNA
• 发布于 2018-12-09 10:49
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Illumina microarray未标准化数据分布

不同于affy包对affymetrix芯片数据分布绘图，Illumina microarray数据分布是基于lumi包： boxplot-method density-method affy包也可以利用boxplot，不过密度图确实利用hist,此处就展示一...

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• Daitoue
• 发布于 2018-12-07 17:23
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芯片RNA降解情况

芯片RNA降解图 RNA的降解是影响芯片数据质量的一个很重要因素，一般，RNA从5端开始降解，所以理论上探针5端的荧光强度应该低于3端。 RNA降解曲线的斜率表示了这种变化趋势，斜率越小，说明降...

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• Daitoue
• 发布于 2018-12-07 16:38
• 阅读 ( 5037 )

WGCNA筛选Biomarker

Biomarker有助于疾病诊断、判断疾病分期或者用来评价新药或新疗法在目标人群中的安全性及有效性。基于WGCNA，对疾病相关的基因表达数据构建网络，鉴定关键模块和hub基因，是筛选Biomarker的有效...

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• Daitoue
• 发布于 2018-12-07 16:24
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iTOL对进化树添加外部标签

iTOL对进化树添加外部标签

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• 安生水
• 发布于 2018-12-07 15:42
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iTOL进化树外层添加圆环

iTOL进化树外层添加圆环

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• 安生水
• 发布于 2018-12-07 15:18
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affymetrix芯片未标准化数据分布

获取芯片原始数据得到为标准化的数据，需要查看原数据的分布情况，可以通过多种方法获得分布图片。 以affy包ReadyAffy()读取CEL结果：AffyBatch对象为例（GSE66196） 1、箱线图：基于boxplo...

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• Daitoue
• 发布于 2018-12-07 14:46
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linux系统使用-生物信息视频课程

linux系统使用，适合初学者

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• omicsgene
• 发布于 2018-12-07 14:36
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芯片灰度图

基因芯片灰度图是最原始的图像，每个灰度值都反映了图像所对应芯片位置的荧光分子相对强度信息。

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• Daitoue
• 发布于 2018-12-07 13:37
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蛋白质等电点的计算

采用biopython 计算蛋白质的等电点

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• 发布于 2018-12-07 13:32
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芯片原始数据标准化的几个包的安装

芯片原始数据下载后进行质控标准化除了基于相关的软件外，也可以利用bioconductor的几个包，不过需要注意介于R版本的问题，包的安装基于install.packages可能安装不成功。

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• Daitoue
• 发布于 2018-12-07 10:38
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iTOL修改进化树的标签基因ID名称

iTOL如何修改标签

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• 安生水
• 发布于 2018-12-07 10:32
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计算lncRNA 与基因的表达相关性

计算lncRNA 与基因的表达相关性

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• 发布于 2018-12-07 10:00
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批量邮件推送python代码模板，可支持html邮件格式

python 批量发送邮件

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• 发布于 2018-12-06 18:32
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阿里云短信发送API笔记

阿里云短信发送API笔记

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• 发布于 2018-12-04 17:39
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分组柱状图添加误差线（位置）--ggplot2

分组柱状图的绘制可以基于ggplot2，具体可以参考: 分组柱状图--ggplot2 。 如何针对分组柱状图添加误差线并合理调整位置呢？主要基于geom_errorbar及其参数position进行细节调整。 譬如基于上...

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• Daitoue
• 发布于 2018-12-04 11:16
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从基因组注释信息GFF文件中提取所有基因位置信息-AWK

从基因组注释信息GFF文件中提取所有基因位置信息-AWK

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• 发布于 2018-12-03 16:47
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grep 统计fasta文件当中有多少条序列

grep 统计fasta文件当中有多少条序列

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• 发布于 2018-12-03 16:35
• 阅读 ( 5777 )

linux命令之grep

linux命令之grep

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• 发布于 2018-12-03 16:16
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