鲈鱼MAPK基因家族分析文献下载:Identification of mapk gene family in Lateolabrax maculatus and their expression profiles in response to hypoxia and salinity challenges.pdf
蛋白质组分析软件MaxQuant
MEME参数使用说明使用说明
TCGA-构建ceRNA网络的软件GDCRNATools
TCGA-ceRNA网络构建
前面两篇文章介绍到pheatmap返回行和列的hclust结果: pheatmap返回的结果解释(获得新的排序信息) http://www.omicsclass.com/article/507 cutree对pheatmap返回结果实现聚类cluster划分 ...
腾讯云服务器获取指南
此前给大家介绍过pheatmap聚类后的矩阵数据重排:http://www.omicsclass.com/article/507 其中给大家介绍到了pheatmap返回结果是一个列表,其中包括行列聚类的返回结果,而这一结果又是基于hcl...
pheatmap是一个热图绘制的R包,全称pretty heatmap。利用的绘图函数是pheatmap(),对应的数据则是一个数值矩阵,譬如基于如下的矩阵10X6: > mat CK-WT-1 CK-WT-2 ...
多基因组基因水平共线性分析
blast 结果说明
用blastall进行序列比对,详细参数说明
bedtools求交集 其用法: bedtools intersect [OPTIONS] [-a|-abam]-b BED 输入文件是bed格式,至少三列,分别...
蛋白质分析,经常要分析蛋白质的保守结构域,通常要展示多序列比对结果才能说明不同序列间的保守性;看到别人分析的蛋白保守结构域都有一个漂亮的多序列比对结果;今天我们就来介绍绘制这种氨基酸比对图:
多基因间共线性及局部基因水平的共线性
采用traceback 进行R语言报错信息的调试
hmmearch搜索结果说明
eclipse下搭建shell脚本编辑器--安装开发shell的eclipse插件shelled
有时候,常用的基因组收录数据库网站上没有收录我们要研究的物种的基因组,比如ensembl,JGI上都没有,这时候我们可以考虑一下NCBI上收录的基因组;但是NCBI上收录的不常见的物种注释信息往往不是很完整,而且基因和染色体编号都会重新命名,用起来很麻烦;所以除非迫不得已,一般不建议从NCBI上下载参考基因组;
Linux系统目录结构