ggplot2绘图结果往往X轴和Y轴的交点往往不是原点:譬如下图y轴就不是起始于0 调整坐标起始位点可以利用scale_y_continuous(expand = c(0, 0))或者scale_x_continuous(expand = c(0, 0)) expa...
在利用ggplot2绘图过程中常会要求Y轴显示为百分比类型,需要借助包scales 和ggplot2中的函数scale_y_continuous(labels)来控制 譬如绘制相关百分比或者密度频率等类型的图片时可以将对应的...
Pathway富集结果常用气泡图来显示,其基本代码如下: 案例数据: > dat ko_id Kegg_pathway Rich_factor Pvalue DEGs1 ko00195 ...
awk统计文件中某列文本出现的次数
perl中一次遍历多个列表
awk命令实现按列求和
详细介绍如何利用iTOL在进化树中用颜色体现样品分组信息。
安捷伦外显子捕获
实时定量PCR也转录组结合,计算表达量等等;
请问,在TCGA差异分析课程中的差异表达矩阵是用ensembleID表示lncrna,而TCGA生存分析的表达矩阵是用lncrna的gene symbol,请问是怎么转换的,用ensemble官网转换之后,代码总报错,请问该怎么...
CD-HIT合并pacbio转录本
Pacbio三代无参全长转录组(IsoSeq3) 的转录本合并策略
miRWalk: 一个预测人类miRNA靶基因的网站
LncBase: 一个预测人类miRNA 靶向lncRNA的网站
绘制柱状图,Y周断裂方法设置
TCGA数据中如何区分样本是癌症还是癌旁
木薯NBS基因家族分析原文献下载:木薯基因家族文章.pdf
利用MeV绘制热图,方法可参考: http://www.omicsclass.com/article/263 其中对热图颜色模式进行修改主要在Display中完成,具体可以通过Display-->Color Scheme 进行(见下图): Gree...
Perl 中的特殊变量 $&, $`,$' 用在模式匹配中 $& 用来存放匹配中的值 $` 用来存放匹配中之前所有字符 $' 用来存放匹配中之后所有字符 如: #!/usr/bin/perl -wmy $a =...
TCGA 数据进行lncRNA, Gene 的WGCNA 联合分析