Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 可变剪切分析软件lr2rmats
SRA提交数据,作者信息
linux中cat命令可以按行合并多个文件,而按列合并多个文件也是可以的。用到的命令是paste。
linux 重定向
利用ggplot2进行x、y坐标轴互换只需借助coord_flip()即可,譬如,以ggplot2绘图代码 http://www.omicsclass.com/article/92 为例,添加一个坐标互换函数,实现互换 library('ggplot2')libr...
CentOS linux的环境变量配置
UbuntuLinux系统环境变量配置
在Windows中文件的换行符与linux中是不同的,其在linux中显示为^M,在使用脚本处理时并不希望有这个符号,所以需要去掉此符号,其方法如下: sed -i 's/^M//g' test.txt ^M 是回车换行符...
对于KRONA图,相信大家都不会陌生。这么复杂的图画起来也很麻烦吧!但其实并不麻烦,在Windows完全可以自己搞定。
R语言中可以将图片结果保存成pdf或者png,具体涉及两种方法: pdf()和png() 以ggplot2绘图结果: http://www.omicsclass.com/article/92 的图片保存为例 pdf(file = "p.pdf",width =1...
这里简单介绍两个隐藏图例的方法 其一利用引导元素guides实现: 譬如借用www.omicsclass.com/article/92 分组柱状图代码: library('ggplot2')library('reshape2')A = c("A","B","C","D","E"...
WGCNA 根据KME值筛选hub基因
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 数据合并
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 分析软件Cogent 的安装
linux字符串截取
演示ggplot2几个默认的主题类型,直接套用对应的函数即可 数据参考 http://www.omicsclass.com/article/92 dat type Sample Num1 A sample1 902 B sample1 343 C sample1 ...
绘制饼图的过程中,利用ggplot2的geom_bar结合coord_polar实现,需要理解的点是饼图的排布是按照aes(fill)的因子顺序确定的。譬如数据如下 > dat type Num1 A 902 B 343 C 56...
R语言-相关性计算
perl 中 grep 的使用
基因功能注释数据库DAVID 版本的选