topGO报错

在r包topgo里面绘制node图的函数是showSigOfNodes(),其中提供的第二个参数不能有0,否则会报错: showSigOfNodes()拆分之后是: sampleGOdata和score(resultKS.elim)是提供给函数的       ...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-01-22 11:51
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cytoscape安装报错:No JVM could be found on your system

cytoscape安装报错:No JVM could be found on your system,通常是由于不适配的java版本

泛基因组可视化

泛基因组可视化

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-09-07 15:18
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Orthofinder-构建物种系统发育树(Phylogenetic tree)

在前一篇文章里写了使用OthroFinder软件构建物种同源基因分析的工作原理的介绍,这次就利用Orthofinder结果中的数据来绘制物种系统发育树(Phylogenetic tree)。 在Orthofinder结果文件中有一...

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  • rzx
  • 发布于 2023-06-15 17:33
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bam文件格式详解

BAM就是SAM的二进制文件,具有更小的存储空间,并且许多下游分析工具使用的是BAM格式。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-05-16 10:00
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Minimap2安装与使用

minimap2是生信大牛Heng Li在2018年发表的三代序列比对工具。与传统的bwa相比,Minimap2可以用于三代测序, 也支持 splicing awared 比对;与一些传统三代比对工具相比,Minimap2 速度非常快,...

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  • 星莓
  • 发布于 2023-05-12 11:07
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linux使用ossutil下载阿里云数据

linux使用ossutil下载阿里云数据

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  • 发布于 2023-03-31 16:30
  • 阅读 ( 3240 )

OrthoFinder 输出结果文件说明

OrthoFinder 输出结果文件说明

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-13 14:12
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最全进化树构建知识点大盘点

最全进化树构建知识点大盘点

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-10 15:56
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保姆式教程!手把手教你使用Simplot,绘制高大上的序列相似性图片

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将fasta序列多行变单行——使用 awk 或 seqkit 或 python

fasta序列多行变单行

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  • 发布于 2022-12-26 16:03
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win11/win10安装最新版本的docker

win11安装docker

NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta,gff3,gtf,gb文件等

NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta,gff3,gtf,gb文件,以及获得细胞器基因组的全部基因名称

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  • 发布于 2022-12-05 14:58
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seqkit序列处理神器的常用命令

seqkit是一个序列处理神器,有统计、格式转换、长度筛选、质量值转换、翻译、反向互补、抽样、去重、滑窗、拆分等功能。 seqkit 一共有37个可用的命令,详细内容如下

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  • 发布于 2022-11-18 17:22
  • 阅读 ( 5456 )

qiime2分类器的训练

训练分类器 Training classifier 因为不同实验的扩增区域不同,鉴定物种分类的精度不同,提前的训练可以让分类结果更准确。在本教程中,使用到的是已经训练好细菌V4区的分类器,可在QIIME2官网...

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  • xun
  • 发布于 2022-11-14 15:26
  • 阅读 ( 2407 )

STRING蛋白互作网络图绘制及子网络分析

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R包hdf5r安装失败 SeuratDisk 安装失败

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-01-22 10:23
  • 阅读 ( 5427 )

GWAS模型介绍

GWAS模型介绍

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  • omicsgene
  • 发布于 2021-11-15 13:17
  • 阅读 ( 14244 )

GEMMA软件下载安装

GEMMA软件下载安装

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  • 安生水
  • 发布于 2021-11-12 15:07
  • 阅读 ( 4345 )

cBioportal使用教程

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