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两分钟看懂基因组注释GFF文件

随着大数据时代的到来，很多生物科研工作者都接触了基因组相关实验。在做数据分析的时候，会用到一个很重要的文件，就是基因组的注释文件，也就是今天分享内容的主角GFF文件！什么是GFF文件...

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landy
发布于 2018-04-22 21:00
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两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图！

使用FigTree制作漂亮的系统发育树。这款软件需要在JAVA环境下运行，所以使用前记得要安装JAVA。第一步：选择合适的树形使用File – open 打开树文件（一般为.nwk文件），在左上方绿色...

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landy
发布于 2018-04-22 18:38
阅读 ( 30770 )

PubMed文献按影响因子排序

PubMed 按影响因子过滤文献

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omicsgene
发布于 2018-04-22 14:45
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外源插入位置查找好方法

简单高效的查找外源基因插入位置的方法，并可以设计共显性标记，方便后续实验验证。

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omicsgene
发布于 2018-04-22 14:32
阅读 ( 6023 )

你不知道的微生物互作分析方法

16s测序数据除了进行常规的Alpha多样性分析，Beta多样性分析，以及PCA分析之外，还能做什么？

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Daitoue
发布于 2018-04-20 19:07
阅读 ( 19472 )

cytoscape软件的安装与使用_v3.10.2

Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络，并依据基本的数据的结合成可视化网络。

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rzx
发布于 2024-04-30 17:41
阅读 ( 4932 )

在Windows系统中安装并使用seqkit工具

seqkit软件介绍： Seqkit是一款专门处理fsata/q序列文件的软件，由go语言编写，功能比较完善，软件使用也很稳定。下载链接：https://bioinf.shenwei.me/seqkit/download/ 下载方式： 1. 点...

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rzx
发布于 2024-03-19 17:01
阅读 ( 2567 )

topGO报错

在r包topgo里面绘制node图的函数是showSigOfNodes()，其中提供的第二个参数不能有0，否则会报错： showSigOfNodes()拆分之后是： sampleGOdata和score(resultKS.elim)是提供给函数的 ...

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Ti Amo
发布于 2024-01-22 11:51
阅读 ( 1266 )

cytoscape安装报错：No JVM could be found on your system

cytoscape安装报错：No JVM could be found on your system，通常是由于不适配的java版本

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每天学习一点点
发布于 2023-11-23 17:41
阅读 ( 2487 )

使用MCscan进行多物种共线性分析与绘图

在基因家族分析中，有时候我们会想要知道我们所关注的基因家族在不同物种基因组间的同源性情况，或者只是简单的想要了解物种间染色体的进化关系，这时候就需要进行物种间全基因组的共线性分析，然后根据共线性分析结果进行可视化。今天我们就来教大家使用一款常用的共线性分析和可视化软件——MCscan，进行多物种的基因组共线性绘图。