bioperl同时读取双端的fastq文件
在R语言中如何获取两个向量之间的交集与并集? 交集可以用intersect 并集可以用union 譬如针对A,B两个向量: > A=LETTERS[1:10]> B=LETTERS[5:15]##交集 > intersect(A,B)[1] "E" ...
基于linux版megacc构建系统进化树命令如下: -a输入的是构建进化树的参数 .mao文件 -d输入的是多序列比对之后的结果文件,可以是fasta格式 -o 是输出路径 其中一个重要的文件 也就是参...
一个植物ceRNA数据库-植物也可以做ceRNA了
NCBI基因组数据格式修改
定量蛋白质组分析的R软件包proteus
sed命令输入行
寿命表法计算中位生存期
去除fasta或fastq文件中ID重复的序列
perl读写gz压缩文件
linux 远程服务器文件上传下载使用软件Filezilla,可把windows的文件上传到服务器,同样可以下载到本地。
iTOL图片导出问题,需要合并性状路径。
MENA可以在线分析OTU互作网络(共现性网络) 可参考:http://www.omicsclass.com/article/68 或 微生物OTU网络图绘制(Cytoscape) MENA在完成构建网络(Construct the network)之后,可以对网...
用putty登录远程服务器
WGCNA基本知识点
NCBI上下载种子基因的蛋白质序列,可用于鉴定没有Pfamily好的基因家族。
再一次给大家介绍一篇不用做实验,只需要进行TCGA数据库挖掘,就能发的SCI的金思路
ncbi基因组数据格式转换
R里面有几个内置常量,方便我们直接调用而非创建: 1、26个字母LETTERS, 小写字母怎么办? 有letters > LETTERS [1] "A" "B" "C" "D" "E" "F" "G" "H" "I" "J" "K" "L" "M" "N" "O" "P" "Q...
VennDiagram是进行Venn图绘制的 R包,最多能够绘制五组数据,其中一个主要的绘图函数为venn.diagram() 针对该参数相关的参数调整,可以直接对Venn图的颜色字体等多主题进行修改。而其绘图数据...