miRNA与靶基因相关性作图
在没有位置信息时,提取miRNA前后500bp的序列
除了利用Figtree等对进化树进行美化之外:两分钟做一张让人羡慕的系统进化树图!也有不少在线工具可以实现这项工作,譬如iTQL:http://itol.embl.de/ 进入网站主页之后,选择Upload进入数据上...
有时候我们需要得到序列的反向互补序列,可以用下面的脚本来批量处理序列。
Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外,还可以利用软件之际对多样品数据中注释到Mapmen通路的数据进行venn图绘制。主要操作过程如下: 从Experiments导入表达数据,具体参考文章:植物...
TCGAbiolinks 下载临床数据,警惕有多次随访数据
如何从某一个文本文件中随机抽取一部分数据。譬如右下方这样的基因表达量数据的统计文件ref_trans_full_table.xls目标是由此文件中随机抽取一部分数据。 可以利用shuf获取随机数据,譬如随机...
dell服务器R430硬盘点击阵列卡
Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护
TCGA数据分析ceRNA的套路
2维韦恩图各部分基因上下调数量统计
Mapman除了对基因进行注释及表达数据可视化之外,还可以利用软件之际对多样品数据进行聚类分析。主要操作过程如下: 从Experiments导入表达数据,具体参考文章:植物代谢通路注释+基因表达可视...
1、第一步先将软件添加到路径中 2、第二步,win+r,输入cmd,此处以QQ为例 下次直接打开这个就行了,不用点其他的了 3、在win+r界面可以经常使用小软件,如,calc等等。。。。
python学习2
1:、数值类型 整型、浮点型、布尔型、复数型 整型:1;2 浮点型:a=1.1;b=2.3 布尔型:True;False 复数型:e=1+1j 2、查看类型 令a=1 dir(a) 3、查看数据类型 4、a+=1等于a=a+1 a-=1...
推荐一个Mapman 本体查询的网站:GoMapman(http://www.gomapman.org/) 网站主要涉及了蛋白、代谢物以及sRNA在Mapman注释通路的查询。通过完整可以浏览具体的通路上可能会涉及那些基因,也可...
组学大讲堂问答社区,欢迎您加入 www.omicsclass.com
借助rmvnorm()生成一个多维正态随机矩阵 安装mvtnorm包 > install.packages("mvtnorm")> library(mvtnorm) 生成随机矩阵x=rmvnorm(n,mean=rep(0,nrow(sigma)),sigma=diag(length(mean)…)...
2018年最新利用TCGA/GEO数据库挖掘文章列表
perl中的正则表达式