linux处理fasta和fastq序列

linux命令处理fasta序列

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-21 22:46
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GEO数据芯片数据挖掘-在线工具分析GDS数据

自己没有数据,或者科研经费较少或者紧张,科研实验还要继续,利用GEO数据库筛选分子再做后续分析不失为一种经济而又快速的方法。本文详细讲解如何利用GEO数据库在线工具分析差异基因筛选全过程。

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-21 17:31
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Excel数据分析技巧之方差分析

做方差分析,用Excel,简单、快捷、方便,你值得拥有!

科研汪必须知道的实验技术,你还差几门?

成为一个资深的生物学科研汪必备的实验技能,你有必要来看看你知道多少!

关于基因家族成员构建进化树时报错如何处理!

有老师在做基因家族分析时,构建进化树时会报错,如何处理?

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  • landy
  • 发布于 2018-06-15 11:31
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使用GATK call SNP有必要IndelRealigner吗?

使用GATK call SNP有必要IndelRealigner吗?

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-15 11:15
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火山图--ggplot2

利用ggplot2进行火山图的绘制

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 09:59
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基因组中的字符都代表什么

参考基因组里除了ACTGN以外,还会看到其他一些字符,看一下这些字符都代表什么?

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-15 09:54
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melt函数对数据进行整合

借助reshape2包melt函数对数据进行整形处理,改变数据组合方式

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-15 09:30
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linux下解压命令

在下载或上传文件时,会碰到很多压缩文件,种类较多,这里就介绍一下各种常见类型的文件如何压缩以及解压缩

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-14 17:44
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perl处理文件路径

以前处理文件路径的时候都是自己写正则表达式,而用perl的模块来解决则更加迅速、准确。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-14 15:51
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从GTF中提取lncRNA的编号和名称

从GTF文件中提取lncRNA对应的ID和名称

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  • microRNA
  • 发布于 2018-06-08 17:28
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绘制类似于箱线图的散点图

使用R语言绘制类似于箱线图的散点图

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-08 12:06
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fastq文件查看指定序列

在处理fastq文件时,可能会遇到序列与质量值长度不一致或格式不正确等问题,这时候软件会报告哪条序列有问题,并给出序列ID,然后我们就要去查看这条序列是什么问题。但是,fastq文件通常是很大的,使用less命令可能很难搜索到

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-08 11:48
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Bio-Linux中的生物信息学软件

Bio-Linux中有很多安装的生物信息学软件,这里给大家列举一下:

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-06 17:49
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linux系统当中源码安装R,无root权限安装

1.安装zlib1.2.5版本及以上 cd zlib-1.2.11 ./configure --prefix =/share/work/biosoft/zlib make make install 2.安装bzip cd bzip2-1.0.6 make -f Makefile-libbz...

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-02 18:03
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Perl读写Excel

生信分析是用的 .xls 文件 大多是文本格式的文件,是可以被Perl读取的,但遇到真的excel文件时,就不行了,这时候就需要使用模块 使用的模块为: Spreadsheet::ParseExcel Spreadsheet::Writ...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-01 13:59
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R-对NA 数据进行处理

对数据中存在的NA情况进行处理,替换或者删除

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-01 13:54
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linux系统中ls命令的常用用

ls命令是linux下最常用的命令。ls命令就是list的缩写,缺省下ls用来打印出当前目录的清单,如果ls指定其他目录,那么就会显示指定目录里的文件及文件夹清单。通过ls 命令不仅可以查看linux文件夹...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-01 13:18
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perl 读取文件中的科学计数数字

Perl读取文件中的科学计数法数字是是以字符串读取的,需要将其转化为小数,方法如下 use Math::BigFloat;my  $i = new Math::BigFloat '1.931533e-01'; 这里用到了Math::BigFloat这个包,就...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-01 13:11
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