MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件,在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候,大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。
clusterProfiler做非模式物种的功能注释
配置JAVA环境,运行java程序
StatET是一个eclipse R语言高亮显示插件,可以高亮显示R语言代码。安装之前请在电脑中提前安装好R编译环境。 支持在Eclipse平台上(通过将代码发送到R)运行R代码 支持语法高亮显示 支持使用R代码模板 支持创建R的文档文件(*.Rd) 可以从Eclipse运行R命令
在进行数据处理的过程中,可能会要求删除向量中某个指定的元素,这一操作可以利用R 语言向量中每个元素都对应一个索引完成,而获取索引下标可以利用which(),而match()只会返向量中第一次出现的...
利用factor() 或者ordered() 两个函数将普通变量转换成有序因子。
将Windows中该文件的内容粘贴复制到linux文件中,用perl读取并保存到哈希中,然后读取另一文件的第一行,判断他第一列的内容是否在上一个文件中存在,结果总是不存在,然而明明就在啊,怎么会不存在呢,一遍遍检查代码也找不到问题。到底为什么呢?
meme软件中的fimo程序可以查找指定序列中的motif结合位点,这里介绍一下他的在线版用法。
转录本组装软件StringTie的使用说明
转录组比对软件HISAT2的使用说明
该篇文章以大田环境下心叶期京科968玉米品种为材料,研究的是在此时期玉米遭受亚洲玉米螟为害时所诱导产生的直接和间接的防御反应及其生理生化和分子机制。下面直接看论文都写了哪些内容。...
数据统计显示FGF21突变和甜食偏好、更低的体脂、更高的血压有关。
菠萝WRKY基因家族分析
TCGA的ENSG编号转换成gene symbol
在线GO富集分析
matplotlib安装
代码高亮显示tips。
利用GEOquery包的getGEO()可以进行芯片相关数据的下载,不过,有人反映不少芯片的表达矩阵下载经常出错,可以通过手动下载的方式将矩阵文件下载到对应的工作路径中: 矩阵文件的基本命名格式...
BLAST+是使用非常广泛的序列比对软件,有NCBI提供
之前在做dcaps标记,开始只找到网站版的软件,后来发现一个不错的脚本软件——SNP_Primer_Pipeline