手把手教你使用GSEA分析！
准备好分析需要的文件，在GSEA官网下载分析软件（软件可以免费下载，需要配置java环境）就可以进行GSEA分析。 打开分析软件，第一步是载入数据，如下图所示，点击红箭头指向的1出的Load data会...
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- landy
- 发布于 2018-07-06 12:53
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landy
microRNA
常见的OrgDB包，方便对应物种注释
列举了19个OrgDB，物种对应的全基因组注释R包，方便根据EntreZ进行基因的注释分析等等 物种 OrgDB 按蚊（Anopheles） org.Ag.eg.db 拟南芥（Arabidopsis） org.At.tair.db 牛（Brov...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-05 22:47
- 阅读 ( 18205 )
Daitoue
omicsgene
Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色
Vennerable绘制维恩图颜色比较丑如何自己设置颜色。
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-04 12:02
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R语言统计相同ID出现的频率并用ggplot2绘制柱状图
统计相同ID出现的频率，并用ggplot绘制柱状图；
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-01 15:46
- 阅读 ( 9066 )
百万样品GWAS解释精神疾病间的遗传关系
2018年，《Science》一篇研究论文通过对上百万例实验样品数据进行分析，揭示不同精神疾病之间享有共同的遗传变异，然而神经性疾病表现更为独立。
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- omics007
- 发布于 2018-06-29 22:13
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omics007
红橙子
perl语言——正则表达式
正则表达式(regular expression)描述了一种字符串匹配的模式，可以用来检查一个串是否含有某种子串、将匹配的子串做替换或者从某个串中取出符合某个条件的子串等。 Perl语言的正则表达式功能非...
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- 安生水
- 发布于 2018-06-29 14:32
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安生水
R处理大数据时内存out of memory的问题
R处理大数据时偶尔会出现out of memory的问题，相关解决方法： 1、memory.size()查看当前work space内存使用状况（MB） 2、memory.limit()查看当前work space运行使用内存的上限 > memo...
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-29 13:16
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统计不同样品-生物学重复基因表达量数据合并和绘图统计
处理统计RNA-seq 表达量数据，绘制柱状图，PCA散点图，还有不同样品表达基因维恩图。
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- omicsgene
- 发布于 2018-06-28 23:52
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微生物互作网络构建教程网站--Microbial association network construction tutorial
基于微生物16s测序数据中的OTU丰度矩阵可以进行微生物互作网络构建，从而探索微生物之间的互作关系。而网络的构建方法多种多样，下面给大家推荐一个网站，Microbial association network constr...
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-28 22:18
- 阅读 ( 5273 )
转录组分析时，影响差异基因数量的因素有哪些？
差异基因的筛选是基于统计学意义的，不能直观的通过两个数值的大小判断差异基因的是否。 首先：受测序深度的影响，有些样品的测序深度较深，可能导致该样品的readcount数值较高，做差...
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- landy
- 发布于 2018-06-28 16:33
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Cufflinks,Stringtie 合并转录本之后，如何筛选新转录本？
GTF文件中class code 注释转录本的类型
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- microRNA
- 发布于 2018-06-28 09:51
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搭建生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）
搭建自己的生信编程环境eclipse+perl+python+R（java环境）
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- omicsgene
- 发布于 2018-06-25 15:45
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