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叶绿体基因组四个区边界作图——irscope：本地化及使用教程（2023.02）

大部分植物的叶绿体基因组具有典型的四分体结构，即由LSC、SSC以及一对IR区域构成，IR和SSC区域的收缩与扩张是常见的进化事件。通过irscope工具可以将多个物种叶绿体的区域边界进行可视化对比...

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  • 星莓
  • 发布于 2023-02-15 15:53
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MISA(在线)注释叶绿体基因组SSR

SSR (Simple Sequence Repeat)，即简单重复序列，是一种以PCR技术为核心的DNA分子标记技术，也称为微卫星序列或者串联重复。

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  • 发布于 2023-02-06 11:04
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基于WSL2的docker更改存储位置

基于WSL2的docker更改存储位置

安装R包的几种方法

1.从CRAN安装；2.使用BiocManager安装；3.从github安装

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  • 星莓
  • 发布于 2023-01-14 15:20
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CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'

使用conda时报上面的错，一般是因为路径错误 使用这个命令获取路径 conda info | grep -i 'base environment' 用得到的路径替换下面命令中的路径 source 路径/etc/profile.d/conda.sh 运...

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  • xun
  • 发布于 2022-12-19 11:20
  • 阅读 ( 1724 )

interpro 查询结构域

interpro 查询结构域

singularity使用基础

singularity使用

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-05 20:49
  • 阅读 ( 6552 )

HMMER ——hmmsearch 用法，参数

HMMER ——hmmsearch 用法，参数

r绘图0不在原点的问题

使用plot画图的时候，只是设定xy轴范围仍然在0之前会有一小段多出来的范围 例如：plot(runif(10,0,10),type="l",xlim=c(0,10),ylim=c(0,10)) 使用：xaxs/yaxs="i" 代码即可解决 例如：plot(r...

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  • xun
  • 发布于 2022-10-21 17:29
  • 阅读 ( 2512 )

notepad++显示所有字符（隐藏的回车换行空格）转换CRLF

notepad++显示所有字符（隐藏的回车换行空格）转换CRLF

关于CodeML分析中Branch-Site模型假设

branch-site models 类似于branch model和site model的合集，主要假设基因的不同位点间（site）和系统发育树的不同分支间（branch）的ω值均是变化的，目的是检验前景枝中正选择作用对部分位点的...

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  • rzx
  • 发布于 2022-10-10 17:12
  • 阅读 ( 2972 )

区分cds utr.exon

区分cds utr.exon

基因组重复序列分类 转座子

基因组重复序列分类

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  • 发布于 2022-09-06 10:27
  • 阅读 ( 8834 )

NCBI、ENA高通量测序数据下载-fastq数据

NCBI高通量测序数据下载-SRA数据库

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  • 发布于 2022-08-15 09:49
  • 阅读 ( 6240 )

基因组Hic挂载AGP文件格式说明

基因组Hic挂载AGP文件格式说明

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-07-20 17:20
  • 阅读 ( 2878 )

IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践

IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-06-09 16:52
  • 阅读 ( 6340 )

docker 报错 error during connect: In the default daemon configuration on Windows,

error during connect: In the default daemon configuration on Windows,

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  • 发布于 2022-05-25 12:11
  • 阅读 ( 5703 )

TCGA数据库重大更新-数据如何下载？

TCGA数据库重大更新-数据如何下载？

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  • omicsgene
  • 发布于 2022-04-28 17:48
  • 阅读 ( 6497 )

2022年最新2区纯转录组文章如何写作？

纯转录组发文章现在是越来越难了，这是真的吗？我有一个朋友人家可不这么认为，只要思路对，纯转录组2区文章也能发！而且还没那么难！真是不同人不同命，你看起来难上难，人家却信手拈来，今天...

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  • 红橙子
  • 发布于 2022-04-20 14:29
  • 阅读 ( 4066 )

如何鉴定长距离运输的mRNA?

上一期给大家介绍了一篇如何鉴定嫁接中长距离运输mRNA的方法：嫁接中长距离运输的mRNA是如何鉴定的？今天给大家介绍已经发表的第2种鉴定长距离运输的mRNA的方法，两者方法类似，但也各有不同，...

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  • 红橙子
  • 发布于 2022-03-25 20:43
  • 阅读 ( 2308 )