多序列比对-蛋白序列保守结构域比对图绘制 genedoc

蛋白质分析,经常要分析蛋白质的保守结构域,通常要展示多序列比对结果才能说明不同序列间的保守性;看到别人分析的蛋白保守结构域都有一个漂亮的多序列比对结果;今天我们就来介绍绘制这种氨基酸比对图:

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  • 发布于 2018-10-19 10:07
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基因家族分析--低成本SCI文章思路

生物信息发展迅猛,公共数据库中存放着海量的数据,如何利用这些公共数据结合自己的实验发一篇SCI?基因家族分析无疑是个低投入、高产出的好选择。今天我们就拿2018年发表的一篇文献跟大家聊...

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  • 发布于 2018-05-07 15:07
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phytozome植物基因组下载网站

今天主要介绍一下Phytozome网站基因组如何下载,通过blast查询多个物种中得同源基因,以及根据基因相关功能结构域等批量下载相关基因的CDS,PEP等序列信息;

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  • 发布于 2018-04-22 14:21
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ConsensusClusterPlus 包对基因表达数据进行一致性聚类

ConsensusClusterPlus 包对基因表达数据进行一致性聚类

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  • 发布于 2021-05-23 20:44
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蛋白3D结构预测 3D Protein Structure Prediction

蛋白3D结构预测 3D Protein Structure Prediction

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  • 发布于 2021-04-12 13:36
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基因家族(family)与基因超家族(superfamily)的区别在哪里?

简单地说,功能还没有分化,就是小家庭。功能分化了,就是大家庭。一个大家庭包含数个小家庭,就这么个意思吧,非要说的那么玄。

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  • 发布于 2020-07-23 17:30
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转录组测序分析数据库介绍

转录组数据分析常用数据库介绍

qRT-PCR相对定量计算详解 qPCR

实时定量PCR也转录组结合,计算表达量等等;

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  • 发布于 2018-09-20 20:11
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一键搞定批量序列提取TBtools!

用基因ID提取其序列很简单,ctrl+F找到ID对应的序列,ctrl+C、ctrl+V就好了,少量基因的还OK,但是如果有几百个甚至上千个ID,手指会不会很酸爽? 这里墙裂推荐一个软件,功能很强大,就是TBtoo...

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  • landy
  • 发布于 2018-04-22 19:08
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从NCBI当中SRA数据库中下载高通量测序数据

用迅雷替代官方的prefetch批量下载SRA测序数据,更快更稳定!

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  • 发布于 2018-04-22 14:37
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看懂变异记录结果文件(VCF)

做过DNA重测序,群体遗传进化,BSA,GWAS等项目的人都会遇到VCF文件,这个文件记录了全基因组的变异信息,如果不懂VCF文件就无法进行后续分析。

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  • 发布于 2018-04-20 19:29
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蛋白质的理化性质除了用Expasy网站还能用TBtools等分析

基因家族,理化性质分析

基因(加性、显性、上位性)效应

基因(加性、显性、上位性)效应

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  • 发布于 2021-12-22 15:40
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感兴趣的蛋白,如何研究它的结构-Phyre2工具使用介绍

筛选出的蛋白怎么去进一步研究它呢?很多人还只停留在定量水平,蛋白质表达量肯定是一个值得考虑探究的因素,但是蛋白质的空间结构与其功能更是相关;蛋白质结构预测你会吗?今天给你分享一款很...

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  • 红橙子
  • 发布于 2020-12-05 21:50
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kaks和dnds是什么?

kaks dnds是什么

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  • 发布于 2019-01-30 23:58
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投稿时-SCI期刊文章中图片大小如何设置

投稿文章的时候杂志对我们论文当中的图片大小都有要求,关于图片大小的一些概念得明白才能做出符合杂志要求的图片。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-27 14:59
  • 阅读 ( 51305 )

重磅!2018年最新期刊分区变动(1-4区)+2018影响因子汇总表-生命科学类免费下载

Excel表包含信息有:期刊全名、简写名、(2018及2017年)中科院分区、影响因子、学科分类、SCI/SCIE、投稿难易程度、审稿周期及期刊主页链接;并通过红、绿两种颜色来区分升级和降级期刊,期刊分区变化一目了然!进来下载!

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-06-29 22:09
  • 阅读 ( 19668 )

SNP不能转化成CAPS标记?来试试dCAPS吧!

dCAPS是由CAPS标记衍生的分子标记。它是通过引物引入错配的碱基,从而构建或者去除限制性内切酶识别位点的标记技术

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-30 13:41
  • 阅读 ( 19570 )

R语言包安装方法,设置国内镜像加快安装速度

R 在线安装包,设置全局镜像,以免镜像不好链接中断  local({r <- getOption("repos")    r["CRAN"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"    options(repos=r)})  或...

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  • 发布于 2018-05-16 21:31
  • 阅读 ( 21327 )

全基因组加倍/复制介绍(whole genome duplication, WGD)

全基因组加倍/复制(whole genome duplication, WGD)

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  • 发布于 2023-03-02 17:24
  • 阅读 ( 11166 )