植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman
你可以对基因进行功能注释，分析其功能分类以及相关的通路信息，你也能分析基因的表达谱数据，但是你知道如何将二者进行结合吗？在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据？有一个工具可以做...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-20 09:18
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Daitoue
microRNA
关于Cytoscape利用蛋白质互作网络分析info文件绘制网络图过程中节点String_id转换成GeneID 或者Symbol问题
有学员反映在学习GEO芯片数据挖掘，进行利用差异基因进行蛋白质互作网络分析的过程中，获得的info文件中之涉及了String_id，利用Cytoscape进行绘图的过程中无法知道对应的具体基因ID是什么...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-16 10:26
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ggplot2 绘图 离散型颜色选择 ColorBrewer
利用ggplot2绘图 scale_fill_brewer() 或者scale_color_brewer() 会使用到ColorBrewer 配色。可以利用相关的命令查看改配色方案。 library(ggplot2)RColorBrewer::display.brewer.all() 通...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-13 16:53
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安生水
SMB1.0客户端导致的网络驱动器(群辉NAS存储)上的文件无法打开查看编辑等问题（win10)
登陆网络共享存储，找到预处理的文件，结果发现文件打不开，无法编辑，甚至拷贝都出现权限受限问题。但是查看整个权限设置一点问题都没有~~~why? 切换到其他电脑上进行登陆，又没有这个问...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-11 16:36
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omicsgene
小白也能画漂亮的热图--赐你一个非编程热图工具
文章投稿，除了文好当然还要“颜好”！在这个看脸的世界，为了给文章加分，各位老师学生也是做足功课了！但是不会编程敲代码？——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常...
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- Daitoue
- 发布于 2018-07-06 09:07
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统计不同分组差异表达结果并统计上下调基因数目并绘制柱状图
R统计不同差异组合，上下调基因个数；并用ggplot2绘制柱状图。
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- omicsgene
- 发布于 2018-07-03 14:02
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perl 中glob函数
perl中通过文件操作符glob提供相当于shell中的指定多个文件的“通配符”语法功能，文件操作符glob将返回与所指定的glob文件模式相匹配的所有文件的list。
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- 安生水
- 发布于 2018-06-22 14:29
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计算串联重复基因KaKs的时候，aln文件一定要通过脚本转换为axt文件么？这两种文件格式是否可以直接通过修改扩展名来实现？
最近有关计算KaKs的输入文件，有人提出了问题，说是不是可以通过修改后缀名称aln变为axt来改变文件，变成软件可识别的格式？答案是不可以的，因为aln文件跟axt文件的格式是不一样的，因此只能通...
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- landy
- 发布于 2018-06-22 12:07
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landy
GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析
GEO2R是GEO在线分析工具，基于此工具可以对部分GEO样品数据进行基因差异表达分析。
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-21 17:19
- 阅读 ( 37340 )
readxl包读取excel的多个函数简介
readxl包括多个可以读取excel的函数，比之xlsx包更方便
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- Daitoue
- 发布于 2018-06-15 16:09
- 阅读 ( 6814 )
