TWAS分析的原理和工具

TWAS(Transcriptome-wide Association Study)是一种用于研究基因表达和疾病之间关系的方法,通过对全基因组的基因表达数据进行统计分析,以识别与特定疾病或性状相关的基因表达变异。

Upset图绘制

Upset图绘制

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-11-12 16:27
  • 阅读 ( 325 )

exFAT格式的硬盘挂载问题

我们在挂载ntfs格式的硬盘的时候,一般可以正常使用linux命令,不会有啥问题,但是如果硬盘格式是exFAT,会发现有很多问题,比如权限不能改 如何判断自己的硬盘的格式?比如位置在/dev/sdb2,用以下代...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2024-11-11 17:22
  • 阅读 ( 201 )

docker clash 配置

docker clash 配置

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2024-11-05 11:55
  • 阅读 ( 831 )

单细胞转录组数据挖掘流程记录-头颈癌(HNSCC)(GSE181919)

数据介绍: 来自谷歌翻译: 肝细胞癌(HCC)代表了肿瘤微环境与肿瘤发展之间关系的范例。在这里,我们为来自四个相关部位的 10 名 HCC 患者生成了超过 70,000 个单细胞转录组:原发肿瘤、门...

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2024-10-31 14:05
  • 阅读 ( 351 )

安装R包报错 fail to lock directory

这个错误通常发生在尝试使用R的install.packages函数安装新的包时。错误信息"fail to lock directory"意味着R不能锁定用于安装包的目录,这通常是因为之前的安装进程没有正确完成,导致锁文件(一个隐藏的文件,用于防止同时写入目录)仍然存在。

单细胞分析绘制marker基因展示图时如何设置细胞排布顺序

基因展示图时如何设置细胞排布顺序

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2024-10-29 09:47
  • 阅读 ( 266 )

HiC-Pro 报错检索解决

报错: 运行HiC-Pro的时候出现报错: 去看log文件发现: 只能知道是在比对的step1就出现了问题。 问题查找: 此时我们需要去HiC-Pro的scripts文件夹下面去查看Makefile这个文件,看一...

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 2024-10-28 15:12
  • 阅读 ( 289 )

R语言绘制多分组差异分析结果图

R语言绘制多分组差异分析结果图 加载需要的包 2 设置FC和FDR的阈值线 4.3 读入数据  

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-10-25 13:52
  • 阅读 ( 361 )

igraph 报错: libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such file or directory

libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such file or directory

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2024-10-24 12:02
  • 阅读 ( 309 )

安装R包出现链接库缺失的问题

 unable to load shared object '/home/wanghj/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2/00LOCK-igraph/00new/igraph/libs/igraph.so':  libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such fi...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2024-10-24 10:35
  • 阅读 ( 306 )

perl报错:symbol lookup error: xxxxx: undefined symbol: Perl_xs_handshake

glimmhmm是一个基因从头预测的软件,他的运行需要先训练模型再预测基因 报错: 运行trainGlimmerHMM的时候出现报错”undefined symbol: Perl_xs_handshake“ 问题: per调用的lib里面没有相关...

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 2024-10-22 13:55
  • 阅读 ( 305 )

R语言绘制差异表达火山图

R语言绘制差异表达火山图

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-10-14 15:48
  • 阅读 ( 412 )

Scanpy数据结构:AnnData

Scanpy数据结构:AnnData

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2024-10-11 15:42
  • 阅读 ( 626 )

删除指令(rm)报错:"Directory not empty/Device or resource busy"

删除指令(rm)报错:"Directory not empty/Device or resource busy",是什么问题,如何解决

ifconfig不显示ip

如题,在ifconfig的时候如果没有出现IP地址,同时确保自己网络连接没问题 nmcli con show NAME  UUID                                  TYPE      DEVICE  eno1  1377a295-708b-4cb4-a1cb-0...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2024-10-10 15:57
  • 阅读 ( 365 )

idealTree:lib: sill idealTree buildDeps 安装JupyterHub 卡住

idealTree:lib: sill idealTree buildDeps 安装JupyterHub 卡住

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2024-09-29 17:18
  • 阅读 ( 496 )

非负矩阵分解(cNMF)

非负矩阵分解(cNMF)

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2024-09-24 18:11
  • 阅读 ( 610 )

circos改变某两条染色体之间的距离

circos改变某两条染色体之间的距离

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-09-23 15:15
  • 阅读 ( 467 )

10X Visium空间转录组图像

10X Visium空间转录组图像

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2024-09-19 13:20
  • 阅读 ( 441 )