gtfToGenePred报错

使用gtfToGenePred的命令和报错: gtfToGenePred -genePredExt  Drosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf refFlat.tmp.txtDrosophila_melanogaster.BDGP6.46.57.gtf (GFF not supported by t...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-06-13 11:47
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细胞通讯cellchat结果介绍

细胞通讯cellchat结果介绍

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  • omicsgene
  • 发布于 2024-06-12 16:21
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单细胞转录组数据挖掘流程记录-BCC 基底细胞癌(GSE123813)

单细胞转录组数据挖掘流程记录-BCC 基底细胞癌(GSE123813)

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  • 发布于 2024-06-11 17:24
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GEO单细胞转录组数据挖掘示例代码汇总

单细胞数据挖掘示例代码

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  • 发布于 2024-06-11 17:18
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GenePred格式

GenePred格式

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  • 安生水
  • 发布于 2024-06-11 15:46
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R markdwon 代码块选项说明:

R markdwon 代码块选项说明:

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  • 发布于 2024-06-08 15:25
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An introduction to PERMANOVA and ANOSIM

PERMANOVA(Permutational Multivariate Analysis of Variance)和 ANOSIM(Analysis of Similarities)都是用于分析和比较群组间多元数据差异的统计方法。它们特别适用于生态和环境科学领域,...

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  • 发布于 2024-06-05 14:33
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序列的提取和截取

序列的提取是我们生物学分析的基础操作,在许多分析中都会使用到。在这里给大家提供几个提取序列的命令。

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-06-05 14:27
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如何预测CpG岛

在人类基因组的广袤海洋中,隐藏着许多生物学上重要的结构,其中之一就是CpG岛。这些富含CpG二核苷酸的DNA序列区域在基因表达调控中扮演着关键角色。然而,要想有效地理解这些岛屿的功能,首先...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-06-04 14:44
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QTL定位方法介绍

QTL定位方法介绍

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  • 发布于 2024-06-03 09:44
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VScode文档列对齐插件-code alignment

一款VScode中文档列对齐的插件

快速整理shell里面用到的脚本;

shell

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  • 发布于 2024-05-24 10:27
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sed使用

在Linux系统中,sed(stream editor)命令是一个非常强大的文本处理工具。它主要用于对文本文件进行过滤和转换操作,支持非交互式的文本编辑。今天,我们就来深入了解一下sed命令的详细使用方法...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-05-20 15:38
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基于 gff 文件构建 TxDb 包

TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的,用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb (transcript database)包,有两种构建方式,一...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-15 16:45
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基于 gff 文件构建 TxDb 包

TxDb 包是用 GenomicFeatures 包构建的,用于专门注释基因组中转录本、外显子、内含子等的包。 如果是构建从 Ensembl 下载的参考基因组的 TxDb (transcript database)包,有两种构建方式,一...

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  • 安生水
  • 发布于 2024-05-15 16:41
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探索基因大数据的利器——SRA Explorer

探索基因大数据的利器——SRA Explorer

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  • 发布于 2024-05-08 15:19
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惊喜价!转录组299元/个

在运行R时报错缺失libpcre2-8.so.0这个共享库文件

libpcre2-8.so.0是PCRE(Perl Compatible Regular Expressions)库的一个版本,通常用于支持正则表达式。

htop查看程序的io占用

传统的top大家都用的很多,但是top里不会显示磁盘io,而在我们服务器里,磁盘高io往往才是程序运行的瓶颈 新版 的htop新增了io 的查看,读写过高对应选项会变成红色,方便我们查看,除此之外htop还有...

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  • xun
  • 发布于 2024-04-25 11:03
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NCBI 基因组文件下载——datasets

datasets和dataformat是NCBI的命令行(Command line tools)工具,datasets可以下载ncbi上的生物数据,dataformat可以将metadata数据从json格式转化成其他格式类型。 1. 下载工具 curl -o d...

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  • Ti Amo
  • 发布于 2024-04-24 16:52
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