借助perl脚本进行文件整理 | 将按第一列信息整理的文件改成按照第二列信息整理
perl data.pl id1.txt id2.txt 现有一文件，有两列，是按照第一列内容进行展示的，如下图：A green;red;blueB yellow;greenC red;blue;grey;pink;blankD green;grey现在想将文件...
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- rzx
- 发布于 2023-12-28 15:32
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rzx
omicsgene
make Cladogram with microbiomemarker
给大家介绍一个R包用于绘制Cladogram，直接附上代码： if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) { install.packages("BiocManager")}BiocManager::install("microbiomeMark...
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- xun
- 发布于 2023-12-28 11:11
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xun
安生水
BLINK（C版本） 进行 GWAS分析的教程
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- 星莓
- 发布于 2023-12-27 11:31
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星莓
Ti Amo
SURVIVOR工具进行结构变异结果文件的格式转换（bedtovcf）
结构变异结果文件格式转换工具——SURVIVOR
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- 每天学习一点点
- 发布于 2023-12-26 17:31
- 阅读 ( 1421 )
每天学习一点点
R语言中转换成dummy dummy-variables 虚拟变量
转换成dummy dummy-variables
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- omicsgene
- 发布于 2023-12-21 15:11
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GATK|Timeout of 30000 milliseconds was reached while trying to acquire a lock on file raw.vcf.tmp.idx.
解决办法：https://www.omicsclass.com/article/2194 这里还有一个需要做的步骤，就是先将raw.vcf.tmp.idx文件找到并删除，一般情况下这个文件是空的。 然后再在命令行中添加-disable_auto_in...
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- rzx
- 发布于 2023-12-15 10:23
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37门付费精品课程免费送！（此链接微信中打开体验更好）
在这个科研内卷的年代，你没有好设备，没有好材料，没有充足经费，怎么立足？毕业、就业、发文、评职称，靠什么来实现？留给你破局的选择不多！！为此，我们组学大讲堂决定干一票大的！我们将永...
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- 生信老顽童
- 发布于 2023-12-14 11:31
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生信老顽童
SURVIVOR合并单样品SV出错
在做SV、CNV变异检测时，会使用SURVIVOR将不用样品的vcf文件合并到一起，命令如下： ls *.max.vcf >sample_files && /share/work/biosoft/SURVIVOR/SURVIVOR/Debug/SURVIVOR merge...
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- 安生水
- 发布于 2023-12-13 13:51
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trimAL | 多序列比对中剪切掉不保守部分的参数
在生信分析时，经常会做一下蛋白多序列比对。对于比对结果中，一些不保守的列，我们可以选择剪切掉。再进行之后的分析，比如构建进化树，进化树的构建会容易很多。 剪切序列时有一个非常好用的...
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- rzx
- 发布于 2023-12-13 10:51
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InterProScan-蛋白质预测
InterProScan是InterPro数据库提供给用户的一个软件包，通过集成数据库鉴定蛋白质功能、所属的家族及其包含的结构域和位点
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- 每天学习一点点
- 发布于 2023-12-12 16:15
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