问题: 在用BWA进行序列比对时出现:[mem_sam_pe] paired reads have different names: "A00920:973:H5GWJDSX3:2:1103:2582:12633:UMI_AAT_GTA", "A00920:973:H5GWJDSX3:2:1103:1624:12633:UMI...
R 包 osqp安装报错
一个熟悉linux的人,基本不太会为了移动光标而使用较远的方向键,更不会使用鼠标,那这是怎么做到的呢,我们来简单介绍一下 基础移动光标 Ctrl – a :移到行首Ctrl – e :移到行尾Ctrl – b...
绘制venn图,2-7维
arrow 安装失败可
安装R 包RIdeogram时需要下载rsvg,rsvg的安装出现librsvg-2.0的缺失的解决办法
组学大讲堂作为专业的生信培训机构,截止到今天,共计发布60+门生物信息视频教程,涵盖基因组分析、群体研究、转录调控、癌症数据库挖掘、微生物研究、生信基础(Linux、Python、R、Perl)等方...
在基因组组装过程中,我们常常碰到一些复杂的基因组,例如高杂合度、高重复、多倍体或者是基因组本身庞大等情况,而一般大基因组都是伴随着高重复和多倍体的。对于高重复,最佳的方案是测序读长...
解决shell脚本的八进制和十进制转换的问题
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seqkit计算基因组大小
Linux 的字符串截取八种方法
不太理解就是当所有的下机数据合并成vcf文件,后续需要建树和扫描清除分析时应该怎么填写分组txt?
1. 寻找前体:将reads比对到参考基因组上。得到fa文件:对输入reads信息重新整理(将不同样本的reads重新整合到一起);arf文件:比对结果。如果想增加比对结果,可以增加参数-q(比对错配数为1...
1. 寻找前体:将reads比对到参考基因组上。得到fa文件:对输入reads信息重新整理(将不同样本的reads重新整合到一起);arf文件:比对结果。如果想增加比对结果,可以增加参数-q(比对错配数为1...
代码介绍
基因组组装过程中会得到草图的scaffold,需要进一步进行gaps的关闭。TGS-gapcloser 是华大基因开发的,一个利用其他组装或是长度长测序数据对草图进行gap填充的一款软件。
Linux join命令合并文件
qiime2 q2-picrust2 报错问题