BWA mem比对报错 paired reads have different names 解决

问题: 在用BWA进行序列比对时出现:[mem_sam_pe] paired reads have different names: "A00920:973:H5GWJDSX3:2:1103:2582:12633:UMI_AAT_GTA", "A00920:973:H5GWJDSX3:2:1103:1624:12633:UMI...

  • 0
  • 0
  • 星莓
  • 发布于 2023-11-16 13:49
  • 阅读 ( 1360 )

R 包 osqp安装报错

R 包 osqp安装报错

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-11-14 23:13
  • 阅读 ( 780 )

命令行 光标移动技巧

一个熟悉linux的人,基本不太会为了移动光标而使用较远的方向键,更不会使用鼠标,那这是怎么做到的呢,我们来简单介绍一下 基础移动光标 Ctrl – a :移到行首Ctrl – e :移到行尾Ctrl – b...

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2023-11-14 18:04
  • 阅读 ( 936 )

绘制venn图,2-7维

绘制venn图,2-7维

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-11-13 13:59
  • 阅读 ( 970 )

arrow 安装失败可

arrow 安装失败可

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-11-12 07:58
  • 阅读 ( 751 )

R 包RIdeogram安装报错

安装R 包RIdeogram时需要下载rsvg,rsvg的安装出现librsvg-2.0的缺失的解决办法

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 2023-11-10 14:49
  • 阅读 ( 1349 )

双11优惠火热进行中---生信课程历年最大优惠来袭!

组学大讲堂作为专业的生信培训机构,截止到今天,共计发布60+门生物信息视频教程,涵盖基因组分析、群体研究、转录调控、癌症数据库挖掘、微生物研究、生信基础(Linux、Python、R、Perl)等方...

二倍体杂合基因组组装策略

在基因组组装过程中,我们常常碰到一些复杂的基因组,例如高杂合度、高重复、多倍体或者是基因组本身庞大等情况,而一般大基因组都是伴随着高重复和多倍体的。对于高重复,最佳的方案是测序读长...

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 2023-11-08 14:08
  • 阅读 ( 2047 )

shell脚本报错——value too great for base

解决shell脚本的八进制和十进制转换的问题

快速生成iTOL配置文件美化你的进化树

快速生成iTOL配置文件美化你的进化树

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-11-08 10:29
  • 阅读 ( 1851 )

seqkit计算基因组大小

seqkit计算基因组大小

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2023-11-08 10:21
  • 阅读 ( 1361 )

Linux shell字符串截取

Linux 的字符串截取八种方法

  • 0
  • 0
  • 星莓
  • 发布于 2023-11-04 16:37
  • 阅读 ( 774 )

老师您好,请问在群体遗传进化中,模板数据黄瓜的分组,sample 是指的什么?是测序数据下机的样品编号?

不太理解就是当所有的下机数据合并成vcf文件,后续需要建树和扫描清除分析时应该怎么填写分组txt?

  • 0
  • 0
  • shidandan
  • 发布于 2023-11-02 09:41
  • 阅读 ( 842 )

预测miRNA前体

1. 寻找前体:将reads比对到参考基因组上。得到fa文件:对输入reads信息重新整理(将不同样本的reads重新整合到一起);arf文件:比对结果。如果想增加比对结果,可以增加参数-q(比对错配数为1...

  • 0
  • 0
  • rzx
  • 发布于 2023-11-01 15:25
  • 阅读 ( 1026 )

预测miRNA前体

1. 寻找前体:将reads比对到参考基因组上。得到fa文件:对输入reads信息重新整理(将不同样本的reads重新整合到一起);arf文件:比对结果。如果想增加比对结果,可以增加参数-q(比对错配数为1...

  • 0
  • 0
  • rzx
  • 发布于 2023-11-01 15:25
  • 阅读 ( 990 )

数据分析代码2__用法

代码介绍

  • 0
  • 0
  • xun
  • 发布于 2023-10-31 17:32
  • 阅读 ( 762 )

TGS-gapcloser 安装与使用

基因组组装过程中会得到草图的scaffold,需要进一步进行gaps的关闭。TGS-gapcloser 是华大基因开发的,一个利用其他组装或是长度长测序数据对草图进行gap填充的一款软件。

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 2023-10-30 17:19
  • 阅读 ( 2460 )

Linux join命令合并文件

Linux join命令合并文件

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2023-10-30 14:37
  • 阅读 ( 1106 )

qiime2 q2-picrust2 报错问题

qiime2 q2-picrust2 报错问题

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2023-10-30 13:21
  • 阅读 ( 936 )

Unicycler二代、三代混合组装

  • 0
  • 0
  • 星莓
  • 发布于 2023-10-26 14:31
  • 阅读 ( 1544 )