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gbff 格式注释文件转换成gff3注释文件格式

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conda一直卡在Solving environment

在使用conda安装CARD数据库自带软件rgi的时候，发现一直卡在Solving environment这一步，查了不少攻略也没能解决问题， 结果换了mamba后瞬间就安装上了，安装非常方便 conda install mamba -c...

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  • 发布于 2023-04-06 16:37
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stack的利用

Python中可以使用栈（stack）数据结构来分析数据。下面是一个使用栈来判断一个字符串中的括号是否匹配的例子： 在这个例子中，我们首先定义了一个空的栈（stack），然后遍历字符串中的每一个...

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  • xun
  • 发布于 2023-04-06 15:59
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pophelper包安装

pophelper包安装

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-30 10:10
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wgd syn 报错 KeyError: 6.0

KeyError: 6.0

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-29 19:19
  • 阅读 ( 1081 )

dQTL.seq方法研究基因定位

dQTG.seq方法包含dQTG.seq1、dQTG.seq2、smoothLOD、C'、Δsnp index、ED六种计算方法。 其中dQTG-seq1方法利用F2群体极端池标记等位基因数目来预测其基因型数目，通过观测的标记等位基因数目和...

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  • rzx
  • 发布于 2023-03-29 11:56
  • 阅读 ( 2859 )

R语言数据整理——tidyr包

tidyr主要提供了一个类似Excel中数据透视表(pivot table)的功能 tidyr包主要涉及： 1)长宽数据转换；2)列分割与列合并；3)缺失值的简单补齐

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-24 15:57
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Linux单行命令

对文本文件做集合交、并、差运算时可以使用sort和uniq awk常用命令 awk '{ sum += $2 } END { print sum }' myfile        #这个命令将计算myfile文件的第二列的总和并打印出来。awk '{ p...

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  • xun
  • 发布于 2023-03-22 13:13
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基因组注释流程，PASA mysql 数据库启动 exited

基因组注释流程，PASA mysql 数据库启动 exited

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-21 18:03
  • 阅读 ( 1467 )

Docker 使用容器来创建更新镜像

Docker 使用容器来创建镜像

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-20 20:51
  • 阅读 ( 1665 )

【Linux】查看文件中的某几行（中间几行）

【Linux】查看文件中的某几行（中间几行）

Rocky 9.0(Centos 9)服务器安装

Rocky 9.0(Centos 9)服务器安装

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-20 13:24
  • 阅读 ( 2041 )

linux无法自动启动

解决linux无法自动启动

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-16 11:20
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R语言用tidyr包进行长宽数据转换

长型和宽型数据在数据分析中非常常见。 之前我们进行长宽数据转换使用较多的包是reshape或reshape2，原作者新推出的tidyr包对数据整合更加优秀，让我们一起来学习一下如何使用tidyr包进行长宽数据转换。

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  • 星莓
  • 发布于 2023-03-15 18:06
  • 阅读 ( 2289 )

Gene ID、Gene Symbol、UniProtKB等ID的转换你会么？

我们在做数据分析时，经常会遇到不同数据库的基因ID不统一的情况，为了方便后续的数据分析，需要进行基因ID或者名称之间的转换。今天小编就给大家介绍几个在线转换的网站。 Uniprot基因ID/名称...

基因家族共线性分析，利用python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

基因家族扩张或收缩，利用python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

rsync 介绍

"rsync" 是一个功能强大的 Linux 命令行工具，可以在本地和远程服务器之间同步文件和目录。它可以非常高效地传输数据，并支持多种复杂的同步场景。 以下是 "rsync" 的常用选项： "-a" 或 "--a...

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  • 发布于 2023-03-09 16:19
  • 阅读 ( 1133 )

linux NFS 服务手动挂载nas文件

linux NFS 服务手动挂载nas文件

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  • omicsgene
  • 发布于 2023-03-07 15:59
  • 阅读 ( 1587 )

string数据库下载的文件

string数据库下载的文件表头比较复杂，我给大家写一份说明书 1，neighborhood_on_chromosome: 这个特征表示在基因组中，两个基因是否靠近彼此，通常使用染色体上的物理距离来确定。如果两个...

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  • xun
  • 发布于 2023-03-06 15:51
  • 阅读 ( 1595 )

perl语言USAGE 标记

perl语言USAGE 标记

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  • 安生水
  • 发布于 2023-03-03 14:28
  • 阅读 ( 1482 )