blastp 快速比对注释基因，输出注释信息
blastp -query unknown.pep.fa -db /share/work/database/blastdb/swissprot/uniprot_sprot.fasta -num_threads 10 -evalue 0.000001 -seg yes -soft_masking true -lcase_masking -max_hsps 1...
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-21 16:35
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omicsgene
生信阿姨
生信老顽童
contig or scaffold GFF 文件通过AGP文件转换成 染色体 gff文件
contig GFF 文件通过AGP文件转换成 染色体 gff文件
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-17 21:14
- 阅读 ( 1806 )
组装好的基因组通过agp文件得到contig序列
https://github.com/tanghaibao/jcvi/issues/391
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-17 20:33
- 阅读 ( 2298 )
eggNOG 注注释报near "WITHOUT": syntax error
eggnog-mapper 注释
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-16 15:44
- 阅读 ( 1895 )
duplicate_gene_classifier统计全基因组不同类型复制事件的数目
duplicate_gene_classifier属于MCScanX的核心程序，用于基因分类，统计全基因组不同类型复制事件的数目。 命令行格式： $duplicate_gene_classifier Dl Dl是物种缩写，是Dl.blast文件。在运...
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- rzx
- 发布于 2022-11-16 14:00
- 阅读 ( 3533 )
rzx
安生水
Linux安装细胞器组装软件--GetOrganelle
GetOrganelle软件是一款由郁文斌老师开发的一套全新的细胞器基因组组装工具，可以对大规模的细胞器基因组进行快速、准确及自动化组装。
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- 星莓
- 发布于 2022-11-14 11:18
- 阅读 ( 3351 )
星莓
docker 镜像 中plink 出现报错 segmentation fault
docker 镜像 中plink 出现报错 segmentation fault
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-11 13:10
- 阅读 ( 2230 )
Repeat masking in MAKER2 (difference with BRAKER2)
Repeat masking in MAKER2 (difference with BRAKER2)
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-10 10:46
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sklearn中使用pipeline重复处理测试集
pipeline 实现了对全部步骤的流式化封装和管理，可以很方便地使参数集在新数据集上被重复使用。 可以用于下面几处： 模块化 Feature Transform 自动化 Grid Search 自动化 Ensemble Generat...
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- xun
- 发布于 2022-11-07 15:06
- 阅读 ( 1419 )
xun
singularity 利用docker 镜像压缩包构建 sif文件
singularity 利用docker 镜像压缩包构建 sif文件
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-05 20:22
- 阅读 ( 3072 )
runc 与 containerd.io 冲突安装不上runc
/etc/yum.repos.d/docker-ce.repo
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-05 20:14
- 阅读 ( 3017 )
跟着文献学做图 | 用蛋白质序列做主成分分析（PCA）
提到主成分分析，一般我们都是使用Plink，GCTA等软件基于SNP数据来操作，那么如果我们用蛋白质序列，能不能做主成分分析，如何做呢？ 答案是可以做，让我们一起来学习怎样做出与文献一样的图吧~
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- 星莓
- 发布于 2022-11-03 16:49
- 阅读 ( 4175 )
