最新基因家族分析文献详解-冬枣扩展蛋白基因家族分析-11月8日接收

基因家族分析

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  • 红橙子
  • 发布于 2018-12-02 15:23
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R语言apply批量进行t.test

批量t.test

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-11-08 21:53
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hmmsearch搜索蛋白保守结构域结果说明

hmmearch搜索结果说明

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-10-18 14:37
  • 阅读 ( 22951 )

Pacbio 数据相关的几个重要概念

Polymerase Read, Subreads,Circular Consensus Sequence 的概念和相互关系

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  • microRNA
  • 发布于 2018-09-10 14:18
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JASPAR网站预测启动区域有那些转录因子结合位点

JASPAR网站预测启动区域有那些转录因子结合位点

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  • microRNA
  • 发布于 2018-07-27 10:14
  • 阅读 ( 20049 )

利用WGCNA分析提升转录组测序文章档次

下面就给大家介绍两篇利用WGCNA分析基因共表达网络来提升文章档次。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-07-27 09:51
  • 阅读 ( 6449 )

blast比对结果说明

我们作比对时经常用到blast,其比对结果一般都用m8格式(即参数是 -m 8,blast+是 -outfmt 6),但是结果文件中是没有表头的,这里来写一下。

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  • 安生水
  • 发布于 2018-07-20 11:13
  • 阅读 ( 21076 )

你了解SAM和BAM文件吗

当我们测序得到的fastq文件map到基因组之后,会得到一个以SAM或Bam为扩展名的文件。这里将详细介绍SAM和Bam文件!

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  • 安生水
  • 发布于 2018-06-29 09:33
  • 阅读 ( 11968 )

文章问题撰写及发布审核要求

文章发布要求,及审核规定,否则文章、问题、回答、评论将不予审核通过。

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-06-21 17:51
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如何按照影响因子筛选文章--PubMed文献搜索技巧

PubMed文献搜索的一个实用技能--如何按照影响因子进行筛选文章?

转录因子研究方法!

转录因子研究方法

分析基因家族时两种搜索基因家族成员方法比较

在分析基因家族时需要鉴定基因家族成员时,有两种鉴定方法: 第一种、利用蛋白保守结构域的隐马尔科夫模型搜索。 第二种、利用BLAST序列比对搜索基因家族成员。 这两种情况的适用条件:如果要...

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  • landy
  • 发布于 2018-06-08 14:48
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如何将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)或者Symbol

AnnotationDbi 和 结合物种对应的注释文件,将ENSEMBL ID转换成Gene ID(ENTREZID)

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  • Daitoue
  • 发布于 2018-06-07 18:30
  • 阅读 ( 35629 )

TCGA数据下载

TCGAbiolinks 下载 TCGA 数据

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-25 10:30
  • 阅读 ( 5012 )

WGCNA分析要求

WGCNA常见问题

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-25 10:04
  • 阅读 ( 11655 )

perl对文件夹处理

用perl批量处理文件夹下所有文件 opendir()获取目录权柄;readdir()读取目录下文件 #!/usr/bin/perl -w $dirname = "/tmp";         #指定一个目录 opendir ( DIR, $dirname ) || die...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-24 16:15
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beta多样性中的距离矩阵总结

距离矩阵差别:jaccard bray-curtis 欧式距离 unifrac(weighted/unweigted)

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  • omicsgene
  • 发布于 2018-05-24 13:20
  • 阅读 ( 12284 )

转录组数据挖掘的几个建议

如何挖掘数据?明确研究目的,实验方案设计,关注已知的结果,结合表型,进行突破

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  • microRNA
  • 发布于 2018-05-18 11:28
  • 阅读 ( 4398 )

微生物多样性分析之Bray curtis距离

 Bray-Curtis距离是以该统计指标的提出者J. Roger Bray和John T. Curtis的名字命名的主要基于OTUs的计数统计比较两个群落微生物的组成差异。与unifrac距离包含的信息完全不一样相比于jaccard距...

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  • 安生水
  • 发布于 2018-05-18 09:21
  • 阅读 ( 15834 )

给大家推荐两个预测植物顺势作用元件的网站

Plant CARE 地址:http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/ PLACE 地址:https://sogo.dna.affrc.go.jp/cgi-bin/sogo.cgi?lang=en&pj=640&action=page&pag...

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  • landy
  • 发布于 2018-05-17 17:29
  • 阅读 ( 10141 )