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BLAST比对原理就是基于序列的相似性,推断该序列的同源基因,又根据同源基因具有相同功能,从而达到功能注释的目的,这个方法往往是有效的。尽管方法会误判(假阳性)或漏判(假阴性),但目前还没有能替代相似性推断同源性的方法,只能通过设置合理的阈值,尽量减少假阳性和假阴性的发生。但相似性并不能证明同源性。
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