从基因组注释信息GFF文件中提取所有基因位置信息-AWK
grep 统计fasta文件当中有多少条序列
vbox com 失败
biolinux安装包下载链接:https://pan.baidu.com/s/1ui9ndOsjbtgHrJoxxOcTMQ
proteusTMT 分析蛋白质组数据时,meta文件的格式设置非常重要
基于sort()或者order对向量元素排序:返回排序后的向量,后者返回原排序后的索引 例如基于向量A操作(A也可以是数值型): > A=c("A","B","D","C","H","J","E") 1、sort sort(x, decrea...
比较3种差别表达方法对TCGA转录组数据的分析
Putty修改配色方案
bioperl读写fasta/fastq压缩文件
加权基因共表达网络(WGCNA)可以利用基因表达数据,构建出加权的基因共表达网络,从而挖掘协同表达的基因模块,探索基因模块与性状之间的关系。 这种分析方法在生物研究领域中被广泛使用,以...
TCGA临床信息如何正确的保存格式, 避免错行,错列的情况
在进行WGCNA分析的过程中需要基于表达矩阵转换关系矩阵,结合power值构建邻接矩阵,并由此构建TOM矩阵最终构建网络。在代码实现的过程中往往: 1、计算power值 2、基于power直接利用adjacen...
linux 文件权限
TeamViewer 解决外网远程访问内网
python 版本mcscan 分析报错
bioperl同时读取双端的fastq文件
在R语言中如何获取两个向量之间的交集与并集? 交集可以用intersect 并集可以用union 譬如针对A,B两个向量: > A=LETTERS[1:10]> B=LETTERS[5:15]##交集 > intersect(A,B)[1] "E" ...
基于linux版megacc构建系统进化树命令如下: -a输入的是构建进化树的参数 .mao文件 -d输入的是多序列比对之后的结果文件,可以是fasta格式 -o 是输出路径 其中一个重要的文件 也就是参...
一个植物ceRNA数据库-植物也可以做ceRNA了
NCBI基因组数据格式修改