核苷酸多样性π的计算

核苷酸多样性(nucleotide diversity),记为π,是分子遗传学中一个重要的概念,可以作为一个群体遗传的重要指标去衡量种群的遗传多样度水平,也可以用在单个基因的多序列比对之中找到受选择的...

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 5天前
  • 阅读 ( 55 )

给进化树标定化石时间

进化树(Phylogenetic Tree)是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中,每个分支点(节点)代表一个共同祖先,而每个末端的分支(叶节点)代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间,即在进化树上标注时间点,为进化树提供了一个时间框架,便于超度量树的构建

  • 0
  • 0
  • Ti Amo
  • 发布于 2024-07-10 17:43
  • 阅读 ( 1109 )

LD衰减距离

LD衰减距离

  • 0
  • 0
  • 安生水
  • 发布于 2024-06-27 09:50
  • 阅读 ( 913 )

tassel PCA报错

tassel 跑PCA的时候由于SNP位点太多报错

遗传图绘制:

遗传图绘制代码演示

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2024-02-22 15:59
  • 阅读 ( 803 )

docker 镜像 中plink 出现报错 segmentation fault

docker 镜像 中plink 出现报错 segmentation fault

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2022-11-11 13:10
  • 阅读 ( 2111 )

主成分分析(PCA)如何计算方差解释率

我们常看到的PCA图中,每个成分都对应了每个特征方差贡献率。通常,求得了PCA降维后的特征向量,我们就可以绘图,但各个维度的方差解释率没有得到,就无法获得PC坐标的百分比。 (文...

  • 0
  • 0
  • 星莓
  • 发布于 2022-09-02 11:05
  • 阅读 ( 7398 )

群体进化选择消除分析

群体进化选择消除分析

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-09-09 17:00
  • 阅读 ( 8669 )

i遗传进化

i遗传进化

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2021-09-02 18:00
  • 阅读 ( 1621 )

群体遗传进化PCA分析

群体遗传进化PCA分析

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2021-09-01 13:47
  • 阅读 ( 2777 )

群体遗传进化进化树分析方法:

群体遗传进化进化树分析方法:

  • 0
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2021-09-01 13:25
  • 阅读 ( 3160 )

连锁不平衡原理与计算(LD)

连锁不平衡原理与计算(LD)

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-12 14:25
  • 阅读 ( 11092 )

群体结构分析structure原理

群体结构分析structure原理

  • 1
  • 3
  • omicsgene
  • 发布于 2020-11-12 14:08
  • 阅读 ( 14060 )

重测序群体遗传进化分析之—进化树构建

重测序群体遗传进化分析之—进化树构建

  • 2
  • 1
  • omicsgene
  • 发布于 2020-10-14 15:03
  • 阅读 ( 13882 )

GCTA 分析PCA

GCTA 分析PCA

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-10-12 15:41
  • 阅读 ( 4137 )

进化树构建的方法及原理详解

进化树构建的方法及原理详解

  • 1
  • 5
  • omicsgene
  • 发布于 2020-09-29 16:52
  • 阅读 ( 38664 )

群体遗传进化名词解释

遗传进化名词解释

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-09-29 12:55
  • 阅读 ( 8446 )

同源基因概念(直系同源 vs旁系同源 )

分子进化与系统发生同源基因

  • 2
  • 6
  • omicsgene
  • 发布于 2020-09-28 16:37
  • 阅读 ( 21583 )

进化树构建方法及原理

进化树构建方法及原理

  • 0
  • 0
  • omicsgene
  • 发布于 2020-09-28 15:50
  • 阅读 ( 12066 )

使用XP-CLR检测基因组中的选择信号

使用XP-CLR检测基因组中的选择信号

  • 0
  • 2
  • omicsgene
  • 发布于 2020-09-28 14:21
  • 阅读 ( 9813 )