分子进化与系统发生同源基因
进化树构建的方法及原理详解
群体结构分析structure原理
利用Python matplotlib库对基因组同源区域和进化速率进行可视化展示!!!
使用XP-CLR检测基因组中的选择信号
群体遗传进化PCA分析
群体遗传进化进化树分析方法:
重测序群体遗传进化分析之—进化树构建
核苷酸多样性(nucleotide diversity),记为π,是分子遗传学中一个重要的概念,可以作为一个群体遗传的重要指标去衡量种群的遗传多样度水平,也可以用在单个基因的多序列比对之中找到受选择的...
进化树(Phylogenetic Tree)是一种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中,每个分支点(节点)代表一个共同祖先,而每个末端的分支(叶节点)代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间,即在进化树上标注时间点,为进化树提供了一个时间框架,便于超度量树的构建
LD衰减距离
tassel 跑PCA的时候由于SNP位点太多报错
遗传图绘制代码演示
docker 镜像 中plink 出现报错 segmentation fault
我们常看到的PCA图中,每个成分都对应了每个特征方差贡献率。通常,求得了PCA降维后的特征向量,我们就可以绘图,但各个维度的方差解释率没有得到,就无法获得PC坐标的百分比。 (文...
群体进化选择消除分析
i遗传进化
连锁不平衡原理与计算(LD)
GCTA 分析PCA
遗传进化名词解释