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synteny collinearity 区别

synteny collinearity 区别

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  • 发布于 2023-02-23 17:01
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有根树和无根树newick文件中

有根树和无根树newick文件中

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  • 发布于 2023-02-09 14:07
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核苷酸替换模型-GTR是所有模型中考虑参数最多最复杂的模型，其他所有模型是GTR模型的特例

GTR是所有模型中考虑参数最多最复杂的模型，其他所有模型是GTR模型的特例

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  • 发布于 2023-02-02 15:14
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根据GFF文件提取基因组中基因的蛋白，CDS，CDNA序列

https://github.com/TransDecoder/TransDecoder

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  • 发布于 2022-12-28 11:52
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repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件，可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽

repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件，可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽

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  • 发布于 2022-12-07 10:13
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真菌 ncRNA 基因特征及坚定方法

Haas BJ, Zeng Q, Pearson MD, Cuomo CA, Wortman JR. Approaches to Fungal Genome Annotation. Mycology. 2011 Oct 3;2(3):118-141. doi: 10.1080/21501203.2011.606851. PMID: 22059117; PMCID: PMC3207268.

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  • 发布于 2022-11-30 14:07
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contig or scaffold GFF 文件通过AGP文件转换成 染色体 gff文件

contig GFF 文件通过AGP文件转换成 染色体 gff文件

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  • 发布于 2022-11-17 21:14
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组装好的基因组通过agp文件得到contig序列

https://github.com/tanghaibao/jcvi/issues/391

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  • 发布于 2022-11-17 20:33
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Repeat masking in MAKER2 (difference with BRAKER2)

Repeat masking in MAKER2 (difference with BRAKER2)

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  • 发布于 2022-11-10 10:46
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Braker 有转录组数据预测基因 多样本转录组

多样本转录组

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  • 发布于 2022-11-02 17:31
  • 阅读 ( 1779 )

基因组注释分析方法

基因组注释分析方法

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  • 发布于 2022-11-02 10:42
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基因组重复序列分类 转座子

基因组重复序列分类

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  • 发布于 2022-09-06 10:27
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蛋白质的理化性质除了用Expasy网站还能用TBtools等分析

基因家族，理化性质分析

基因组版本 Primary 和 Alternate的区别

Alternate

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  • 发布于 2022-08-18 18:37
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基因组Hic挂载AGP文件格式说明

基因组Hic挂载AGP文件格式说明

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  • 发布于 2022-07-20 17:20
  • 阅读 ( 2458 )

tripal搭建基因组数据库网站

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  • 发布于 2021-12-03 14:05
  • 阅读 ( 2491 )

植物 SSR引物数据库 NAR 发核酸研究

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5210622/

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  • 发布于 2021-09-15 15:21
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必须收藏！比较基因组学分析必备神器-OrthoVenn2

全基因组直系同源基因簇（Orthologousclusters）的分析是比较基因组学研究中的一项重要内容，直系同源基因簇之间的聚类及网络构建有助于解释跨多物种的蛋白质的功能和进化关系，今天小编给大家...

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  • 发布于 2020-12-05 21:12
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基因编辑iPSCS敲除技术原理与潜在的治疗应用

血友病A是由F8基因突变引起的X连锁遗传病，该基因编码凝血因子VIII。在所有严重的血友病A病例中，几乎有一半的病例是由两个总的（140 kbp或600 kbp）染色体倒置导致的，分别涉及

请教kaks分析

请教下各位老师，关于kaks分析的问题。我有50株菌，想看某个基因在这50株菌中是否正向选择。50株菌意味着有50条这个基因的序列，两两比较后就很多kaks的结果，有大于1也有小于1的，那我该如何判...