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核苷酸替换模型-GTR是所有模型中考虑参数最多最复杂的模型，其他所有模型是GTR模型的特例
GTR是所有模型中考虑参数最多最复杂的模型，其他所有模型是GTR模型的特例
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- 发布于 2023-02-02 15:14
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根据GFF文件提取基因组中基因的蛋白，CDS，CDNA序列
https://github.com/TransDecoder/TransDecoder
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- 发布于 2022-12-28 11:52
- 阅读 ( 2539 )
repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件，可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽
repeatMasker 得到的out文件转换成gff文件，可以用bedtools对基因组进行重复区屏蔽
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- omicsgene
- 发布于 2022-12-07 10:13
- 阅读 ( 2228 )
真菌 ncRNA 基因特征及坚定方法
Haas BJ, Zeng Q, Pearson MD, Cuomo CA, Wortman JR. Approaches to Fungal Genome Annotation. Mycology. 2011 Oct 3;2(3):118-141. doi: 10.1080/21501203.2011.606851. PMID: 22059117; PMCID: PMC3207268.
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- 发布于 2022-11-30 14:07
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contig or scaffold GFF 文件通过AGP文件转换成 染色体 gff文件
contig GFF 文件通过AGP文件转换成 染色体 gff文件
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- 发布于 2022-11-17 21:14
- 阅读 ( 1687 )
组装好的基因组通过agp文件得到contig序列
https://github.com/tanghaibao/jcvi/issues/391
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-17 20:33
- 阅读 ( 2153 )
Repeat masking in MAKER2 (difference with BRAKER2)
Repeat masking in MAKER2 (difference with BRAKER2)
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- omicsgene
- 发布于 2022-11-10 10:46
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生信阿姨
植物 SSR引物数据库 NAR 发核酸研究
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5210622/
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- omicsgene
- 发布于 2021-09-15 15:21
- 阅读 ( 2038 )
必须收藏！比较基因组学分析必备神器-OrthoVenn2
全基因组直系同源基因簇（Orthologousclusters）的分析是比较基因组学研究中的一项重要内容，直系同源基因簇之间的聚类及网络构建有助于解释跨多物种的蛋白质的功能和进化关系，今天小编给大家...
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- 红橙子
- 发布于 2020-12-05 21:12
- 阅读 ( 13963 )
红橙子
基因编辑iPSCS敲除技术原理与潜在的治疗应用
血友病A是由F8基因突变引起的X连锁遗传病，该基因编码凝血因子VIII。在所有严重的血友病A病例中，几乎有一半的病例是由两个总的（140 kbp或600 kbp）染色体倒置导致的，分别涉及
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- 源井生物
- 发布于 2020-09-04 11:36
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源井生物
请教kaks分析
请教下各位老师，关于kaks分析的问题。我有50株菌，想看某个基因在这50株菌中是否正向选择。50株菌意味着有50条这个基因的序列，两两比较后就很多kaks的结果，有大于1也有小于1的，那我该如何判...
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- SwallowChou
- 发布于 2020-05-28 19:25
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SwallowChou
44家机构联合破解巨型鱿鱼基因组！
哥本哈根大学牵头，44加机构联合破解巨型海怪基因组！但是看完文章我很失望！
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- omics007
- 发布于 2020-03-20 17:06
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omics007
