awk 具有内置算术函数log(x),以e 为底可以对数据取对数运算,而以其他数值为底进行取对数可以基于这一函数进行转换,譬如 以2为底取对数: log(x)/log(2)即可。 下面针对数据第二列进行取对...
awk统计文件中某列文本出现的次数
awk命令实现按列求和
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linux中cat命令可以按行合并多个文件,而按列合并多个文件也是可以的。用到的命令是paste。
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在Windows中文件的换行符与linux中是不同的,其在linux中显示为^M,在使用脚本处理时并不希望有这个符号,所以需要去掉此符号,其方法如下: sed -i 's/^M//g' test.txt ^M 是回车换行符...
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biolinux共享目录创建及注意事项。
linux命令处理fasta序列
在下载或上传文件时,会碰到很多压缩文件,种类较多,这里就介绍一下各种常见类型的文件如何压缩以及解压缩
在处理fastq文件时,可能会遇到序列与质量值长度不一致或格式不正确等问题,这时候软件会报告哪条序列有问题,并给出序列ID,然后我们就要去查看这条序列是什么问题。但是,fastq文件通常是很大的,使用less命令可能很难搜索到